Protein–RNA interactions for Protein: P35177

SPT7, Transcriptional activator SPT7, yeastyeast

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT7P35177 TRM5YHR070W 1500 nt14.61□□□□□ -0.07
SPT7P35177 YLR235CYLR235C 399 nt14.59□□□□□ -0.07
SPT7P35177 SNG1YGR197C 1644 nt14.58□□□□□ -0.08
SPT7P35177 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt14.56□□□□□ -0.08
SPT7P35177 HEM12YDR047W 1089 nt14.55□□□□□ -0.08
SPT7P35177 PAU16YKL224C 372 nt14.54□□□□□ -0.08
SPT7P35177 RRT5YFR032C 870 nt14.5□□□□□ -0.09
SPT7P35177 YFL067WYFL067W 528 nt14.48□□□□□ -0.09
SPT7P35177 TIM23YNR017W 669 nt14.46□□□□□ -0.09
SPT7P35177 DDR2YOL052C-A 186 nt14.45□□□□□ -0.1
SPT7P35177 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt14.41□□□□□ -0.1
SPT7P35177 YLR179CYLR179C 606 nt14.41□□□□□ -0.1
SPT7P35177 ANP1YEL036C 1503 nt14.41□□□□□ -0.1
SPT7P35177 CCA1YER168C 1641 nt14.4□□□□□ -0.1
SPT7P35177 WSC2YNL283C 1512 nt14.39□□□□□ -0.11
SPT7P35177 YFR018CYFR018C 1092 nt14.39□□□□□ -0.11
SPT7P35177 STB1YNL309W 1263 nt14.37□□□□□ -0.11
SPT7P35177 RAX1YOR301W 1308 nt14.36□□□□□ -0.11
SPT7P35177 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt14.36□□□□□ -0.11
SPT7P35177 AQY1YPR192W 918 nt14.35□□□□□ -0.11
SPT7P35177 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt14.34□□□□□ -0.11
SPT7P35177 SPC25YER018C 666 nt14.33□□□□□ -0.12
SPT7P35177 AHT1YHR093W 549 nt14.3□□□□□ -0.12
SPT7P35177 FEN2YCR028C 1539 nt14.28□□□□□ -0.12
SPT7P35177 BOR1YNL275W 1731 nt14.27□□□□□ -0.13
SPT7P35177 VPS60YDR486C 690 nt14.26□□□□□ -0.13
SPT7P35177 HSP60YLR259C 1719 nt14.25□□□□□ -0.13
SPT7P35177 ALG3YBL082C 1377 nt14.25□□□□□ -0.13
SPT7P35177 PRE6YOL038W 765 nt14.24□□□□□ -0.13
SPT7P35177 MIC12YBR262C 321 nt14.23□□□□□ -0.13
SPT7P35177 AGP1YCL025C 1902 nt14.23□□□□□ -0.13
SPT7P35177 FUR4YBR021W 1902 nt14.23□□□□□ -0.13
SPT7P35177 GPI16YHR188C 1833 nt14.22□□□□□ -0.13
SPT7P35177 CCT4YDL143W 1587 nt14.22□□□□□ -0.13
SPT7P35177 YIR016WYIR016W 798 nt14.17□□□□□ -0.14
SPT7P35177 BNA2YJR078W 1362 nt14.16□□□□□ -0.14
SPT7P35177 YPR064WYPR064W 420 nt14.15□□□□□ -0.15
SPT7P35177 NAT4YMR069W 858 nt14.13□□□□□ -0.15
SPT7P35177 GLK1YCL040W 1503 nt14.12□□□□□ -0.15
SPT7P35177 TAD3YLR316C 969 nt14.11□□□□□ -0.15
SPT7P35177 SWC5YBR231C 912 nt14.1□□□□□ -0.15
SPT7P35177 BDH1YAL060W 1149 nt14.04□□□□□ -0.16
SPT7P35177 HHO1YPL127C 777 nt14.04□□□□□ -0.16
SPT7P35177 DUT1YBR252W 444 nt14.04□□□□□ -0.16
SPT7P35177 XDJ1YLR090W 1380 nt14.02□□□□□ -0.17
SPT7P35177 DUS1YML080W 1272 nt13.93□□□□□ -0.18
SPT7P35177 YFL066CYFL066C 1179 nt13.92□□□□□ -0.18
SPT7P35177 PEX25YPL112C 1185 nt13.92□□□□□ -0.18
SPT7P35177 YGR201CYGR201C 678 nt13.91□□□□□ -0.18
SPT7P35177 PRP4YPR178W 1398 nt13.91□□□□□ -0.18
SPT7P35177 RDN18-1RDN18-1 1800 nt13.91□□□□□ -0.18
SPT7P35177 RDN18-2RDN18-2 1800 nt13.91□□□□□ -0.18
SPT7P35177 YSP3YOR003W 1437 nt13.88□□□□□ -0.19
SPT7P35177 YCL074WYCL074W 927 nt13.88□□□□□ -0.19
SPT7P35177 YLR415CYLR415C 339 nt13.87□□□□□ -0.19
SPT7P35177 DPS1YLL018C 1674 nt13.86□□□□□ -0.19
SPT7P35177 YKR005CYKR005C 1578 nt13.86□□□□□ -0.19
SPT7P35177 MSF1YPR047W 1410 nt13.85□□□□□ -0.19
SPT7P35177 STR3YGL184C 1398 nt13.82□□□□□ -0.2
SPT7P35177 GDH3YAL062W 1374 nt13.82□□□□□ -0.2
SPT7P35177 SHM2YLR058C 1410 nt13.82□□□□□ -0.2
SPT7P35177 YMR244WYMR244W 1068 nt13.82□□□□□ -0.2
SPT7P35177 AVT6YER119C 1347 nt13.82□□□□□ -0.2
SPT7P35177 ALG12YNR030W 1656 nt13.8□□□□□ -0.2
SPT7P35177 SNF1YDR477W 1902 nt13.77□□□□□ -0.2
SPT7P35177 UME6YDR207C 2511 nt13.77□□□□□ -0.21
SPT7P35177 THI74YDR438W 1113 nt13.76□□□□□ -0.21
SPT7P35177 YNL115CYNL115C 1935 nt13.75□□□□□ -0.21
SPT7P35177 YGR259CYGR259C 441 nt13.72□□□□□ -0.21
SPT7P35177 NIT1YIL164C 600 nt13.72□□□□□ -0.21
SPT7P35177 AAC1YMR056C 930 nt13.72□□□□□ -0.21
SPT7P35177 GLR1YPL091W 1452 nt13.72□□□□□ -0.21
SPT7P35177 AQY2YLL052C 450 nt13.7□□□□□ -0.22
SPT7P35177 GOR1YNL274C 1053 nt13.7□□□□□ -0.22
SPT7P35177 BIO5YNR056C 1686 nt13.68□□□□□ -0.22
SPT7P35177 TIM17YJL143W 477 nt13.66□□□□□ -0.22
SPT7P35177 MIR1YJR077C 936 nt13.65□□□□□ -0.22
SPT7P35177 MCH5YOR306C 1566 nt13.64□□□□□ -0.23
SPT7P35177 BMT6YLR063W 1098 nt13.64□□□□□ -0.23
SPT7P35177 SGT2YOR007C 1041 nt13.64□□□□□ -0.23
SPT7P35177 RBG2YGR173W 1107 nt13.59□□□□□ -0.23
SPT7P35177 DAT1YML113W 747 nt13.59□□□□□ -0.23
SPT7P35177 VPS75YNL246W 795 nt13.57□□□□□ -0.24
SPT7P35177 PAU7YAR020C 168 nt13.52□□□□□ -0.25
SPT7P35177 NBP35YGL091C 987 nt13.51□□□□□ -0.25
SPT7P35177 IRC24YIR036C 792 nt13.51□□□□□ -0.25
SPT7P35177 RTN2YDL204W 1182 nt13.48□□□□□ -0.25
SPT7P35177 NAR1YNL240C 1476 nt13.48□□□□□ -0.25
SPT7P35177 YGL034CYGL034C 366 nt13.47□□□□□ -0.25
SPT7P35177 PBP1YGR178C 2169 nt13.45□□□□□ -0.26
SPT7P35177 NDI1YML120C 1542 nt13.45□□□□□ -0.26
SPT7P35177 YCR102CYCR102C 1107 nt13.43□□□□□ -0.26
SPT7P35177 Q0182Q0182 405 nt13.42□□□□□ -0.26
SPT7P35177 PLB1YMR008C 1995 nt13.41□□□□□ -0.26
SPT7P35177 SHH4YLR164W 507 nt13.39□□□□□ -0.27
SPT7P35177 UBA4YHR111W 1323 nt13.35□□□□□ -0.27
SPT7P35177 ARP6YLR085C 1317 nt13.35□□□□□ -0.27
SPT7P35177 YSR3YKR053C 1215 nt13.35□□□□□ -0.27
SPT7P35177 RBG1YAL036C 1110 nt13.34□□□□□ -0.27
SPT7P35177 YDR010CYDR010C 333 nt13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms