Protein–RNA interactions for Protein: P31650

Slc6a11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a11P31650 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc6a11P31650 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc6a11P31650 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc6a11P31650 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc6a11P31650 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc6a11P31650 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc6a11P31650 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc6a11P31650 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc6a11P31650 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc6a11P31650 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc6a11P31650 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc6a11P31650 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc6a11P31650 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc6a11P31650 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc6a11P31650 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc6a11P31650 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc6a11P31650 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc6a11P31650 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc6a11P31650 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc6a11P31650 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc6a11P31650 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc6a11P31650 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc6a11P31650 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc6a11P31650 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc6a11P31650 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc6a11P31650 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc6a11P31650 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc6a11P31650 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc6a11P31650 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc6a11P31650 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc6a11P31650 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc6a11P31650 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc6a11P31650 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc6a11P31650 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc6a11P31650 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc6a11P31650 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc6a11P31650 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc6a11P31650 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc6a11P31650 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc6a11P31650 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc6a11P31650 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc6a11P31650 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc6a11P31650 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc6a11P31650 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc6a11P31650 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc6a11P31650 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc6a11P31650 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc6a11P31650 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc6a11P31650 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc6a11P31650 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc6a11P31650 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc6a11P31650 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc6a11P31650 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc6a11P31650 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc6a11P31650 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc6a11P31650 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc6a11P31650 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc6a11P31650 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc6a11P31650 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc6a11P31650 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc6a11P31650 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc6a11P31650 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc6a11P31650 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc6a11P31650 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc6a11P31650 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc6a11P31650 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc6a11P31650 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc6a11P31650 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc6a11P31650 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc6a11P31650 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc6a11P31650 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc6a11P31650 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc6a11P31650 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc6a11P31650 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc6a11P31650 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc6a11P31650 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc6a11P31650 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc6a11P31650 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc6a11P31650 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc6a11P31650 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc6a11P31650 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc6a11P31650 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc6a11P31650 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc6a11P31650 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc6a11P31650 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc6a11P31650 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc6a11P31650 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc6a11P31650 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc6a11P31650 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a11P31650 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc6a11P31650 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slc6a11P31650 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc6a11P31650 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc6a11P31650 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc6a11P31650 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc6a11P31650 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc6a11P31650 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc6a11P31650 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc6a11P31650 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc6a11P31650 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms