Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa10P31310 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa10P31310 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa10P31310 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa10P31310 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa10P31310 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa10P31310 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa10P31310 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa10P31310 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa10P31310 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa10P31310 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa10P31310 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa10P31310 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa10P31310 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa10P31310 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa10P31310 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa10P31310 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa10P31310 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxa10P31310 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa10P31310 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa10P31310 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa10P31310 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa10P31310 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa10P31310 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxa10P31310 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa10P31310 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa10P31310 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxa10P31310 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxa10P31310 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxa10P31310 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxa10P31310 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa10P31310 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxa10P31310 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxa10P31310 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxa10P31310 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa10P31310 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa10P31310 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa10P31310 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxa10P31310 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa10P31310 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa10P31310 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxa10P31310 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa10P31310 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa10P31310 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxa10P31310 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxa10P31310 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxa10P31310 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxa10P31310 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxa10P31310 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxa10P31310 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxa10P31310 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxa10P31310 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxa10P31310 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxa10P31310 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hoxa10P31310 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hoxa10P31310 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa10P31310 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa10P31310 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa10P31310 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxa10P31310 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxa10P31310 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxa10P31310 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxa10P31310 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxa10P31310 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa10P31310 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa10P31310 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa10P31310 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa10P31310 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa10P31310 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa10P31310 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa10P31310 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa10P31310 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa10P31310 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa10P31310 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa10P31310 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa10P31310 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa10P31310 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa10P31310 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa10P31310 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa10P31310 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa10P31310 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hoxa10P31310 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa10P31310 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa10P31310 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa10P31310 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxa10P31310 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hoxa10P31310 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hoxa10P31310 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa10P31310 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hoxa10P31310 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa10P31310 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa10P31310 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa10P31310 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hoxa10P31310 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hoxa10P31310 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa10P31310 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa10P31310 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa10P31310 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxa10P31310 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hoxa10P31310 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms