Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Hoxa10P31310 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Hoxa10P31310 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Hoxa10P31310 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Hoxa10P31310 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Hoxa10P31310 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Hoxa10P31310 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Hoxa10P31310 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Hoxa10P31310 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Hoxa10P31310 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxa10P31310 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hoxa10P31310 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Hoxa10P31310 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Hoxa10P31310 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Hoxa10P31310 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Hoxa10P31310 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Hoxa10P31310 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Hoxa10P31310 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Hoxa10P31310 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hoxa10P31310 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxa10P31310 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hoxa10P31310 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Hoxa10P31310 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxa10P31310 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxa10P31310 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hoxa10P31310 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hoxa10P31310 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Hoxa10P31310 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hoxa10P31310 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxa10P31310 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxa10P31310 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hoxa10P31310 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hoxa10P31310 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxa10P31310 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hoxa10P31310 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Hoxa10P31310 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxa10P31310 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Hoxa10P31310 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxa10P31310 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hoxa10P31310 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxa10P31310 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hoxa10P31310 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxa10P31310 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxa10P31310 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Hoxa10P31310 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxa10P31310 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxa10P31310 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxa10P31310 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxa10P31310 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxa10P31310 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxa10P31310 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxa10P31310 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxa10P31310 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxa10P31310 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxa10P31310 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxa10P31310 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxa10P31310 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxa10P31310 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxa10P31310 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxa10P31310 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxa10P31310 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxa10P31310 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxa10P31310 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxa10P31310 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxa10P31310 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxa10P31310 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxa10P31310 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxa10P31310 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxa10P31310 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxa10P31310 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxa10P31310 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxa10P31310 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxa10P31310 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxa10P31310 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxa10P31310 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxa10P31310 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxa10P31310 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxa10P31310 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxa10P31310 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxa10P31310 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxa10P31310 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxa10P31310 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxa10P31310 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa10P31310 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxa10P31310 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hoxa10P31310 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxa10P31310 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxa10P31310 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxa10P31310 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxa10P31310 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxa10P31310 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxa10P31310 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxa10P31310 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hoxa10P31310 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxa10P31310 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxa10P31310 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxa10P31310 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxa10P31310 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxa10P31310 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxa10P31310 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms