Protein–RNA interactions for Protein: P27512

Cd40, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40P27512 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd40P27512 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd40P27512 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Cd40P27512 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd40P27512 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd40P27512 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd40P27512 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd40P27512 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cd40P27512 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd40P27512 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cd40P27512 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd40P27512 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd40P27512 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd40P27512 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd40P27512 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd40P27512 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd40P27512 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd40P27512 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd40P27512 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd40P27512 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd40P27512 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd40P27512 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd40P27512 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd40P27512 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd40P27512 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd40P27512 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd40P27512 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd40P27512 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd40P27512 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd40P27512 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd40P27512 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd40P27512 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd40P27512 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd40P27512 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd40P27512 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd40P27512 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd40P27512 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd40P27512 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd40P27512 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd40P27512 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd40P27512 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd40P27512 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd40P27512 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd40P27512 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd40P27512 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd40P27512 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd40P27512 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd40P27512 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd40P27512 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd40P27512 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd40P27512 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd40P27512 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd40P27512 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd40P27512 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd40P27512 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd40P27512 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd40P27512 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd40P27512 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd40P27512 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd40P27512 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd40P27512 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd40P27512 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd40P27512 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd40P27512 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd40P27512 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd40P27512 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd40P27512 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd40P27512 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd40P27512 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd40P27512 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd40P27512 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd40P27512 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd40P27512 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd40P27512 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd40P27512 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd40P27512 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd40P27512 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd40P27512 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd40P27512 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd40P27512 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd40P27512 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd40P27512 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd40P27512 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd40P27512 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd40P27512 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd40P27512 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Cd40P27512 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd40P27512 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd40P27512 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd40P27512 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd40P27512 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd40P27512 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd40P27512 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd40P27512 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd40P27512 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd40P27512 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd40P27512 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cd40P27512 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd40P27512 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd40P27512 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms