Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gabra3P26049 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gabra3P26049 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gabra3P26049 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gabra3P26049 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gabra3P26049 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gabra3P26049 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gabra3P26049 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gabra3P26049 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gabra3P26049 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gabra3P26049 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gabra3P26049 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gabra3P26049 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gabra3P26049 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gabra3P26049 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gabra3P26049 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gabra3P26049 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gabra3P26049 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gabra3P26049 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gabra3P26049 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gabra3P26049 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabra3P26049 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabra3P26049 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabra3P26049 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabra3P26049 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabra3P26049 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gabra3P26049 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gabra3P26049 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabra3P26049 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gabra3P26049 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gabra3P26049 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabra3P26049 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gabra3P26049 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gabra3P26049 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gabra3P26049 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gabra3P26049 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabra3P26049 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gabra3P26049 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabra3P26049 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gabra3P26049 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gabra3P26049 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gabra3P26049 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabra3P26049 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabra3P26049 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gabra3P26049 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gabra3P26049 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabra3P26049 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabra3P26049 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gabra3P26049 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabra3P26049 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gabra3P26049 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gabra3P26049 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gabra3P26049 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gabra3P26049 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabra3P26049 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabra3P26049 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabra3P26049 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabra3P26049 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gabra3P26049 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabra3P26049 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gabra3P26049 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabra3P26049 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gabra3P26049 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gabra3P26049 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gabra3P26049 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabra3P26049 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabra3P26049 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabra3P26049 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabra3P26049 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabra3P26049 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabra3P26049 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabra3P26049 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabra3P26049 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gabra3P26049 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabra3P26049 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabra3P26049 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabra3P26049 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabra3P26049 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabra3P26049 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gabra3P26049 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabra3P26049 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms