Protein–RNA interactions for Protein: P25343

RVS161, Reduced viability upon starvation protein 161, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RVS161P25343 AQY1YPR192W 918 nt10.56□□□□□ -0.72
RVS161P25343 TRM5YHR070W 1500 nt10.56□□□□□ -0.72
RVS161P25343 PTH1YHR189W 573 nt10.55□□□□□ -0.72
RVS161P25343 GLK1YCL040W 1503 nt10.54□□□□□ -0.72
RVS161P25343 DDR2YOL052C-A 186 nt10.54□□□□□ -0.72
RVS161P25343 CCA1YER168C 1641 nt10.53□□□□□ -0.72
RVS161P25343 FUR4YBR021W 1902 nt10.51□□□□□ -0.73
RVS161P25343 TIM23YNR017W 669 nt10.51□□□□□ -0.73
RVS161P25343 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt10.5□□□□□ -0.73
RVS161P25343 MCH5YOR306C 1566 nt10.49□□□□□ -0.73
RVS161P25343 YKL030WYKL030W 606 nt10.49□□□□□ -0.73
RVS161P25343 YLR179CYLR179C 606 nt10.47□□□□□ -0.73
RVS161P25343 ANP1YEL036C 1503 nt10.47□□□□□ -0.73
RVS161P25343 BNA2YJR078W 1362 nt10.41□□□□□ -0.74
RVS161P25343 SPC25YER018C 666 nt10.41□□□□□ -0.74
RVS161P25343 STB1YNL309W 1263 nt10.41□□□□□ -0.74
RVS161P25343 ALG12YNR030W 1656 nt10.4□□□□□ -0.74
RVS161P25343 MIC12YBR262C 321 nt10.39□□□□□ -0.75
RVS161P25343 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt10.38□□□□□ -0.75
RVS161P25343 AHT1YHR093W 549 nt10.38□□□□□ -0.75
RVS161P25343 RTG1YOL067C 534 nt10.38□□□□□ -0.75
RVS161P25343 YPR064WYPR064W 420 nt10.38□□□□□ -0.75
RVS161P25343 GPI16YHR188C 1833 nt10.37□□□□□ -0.75
RVS161P25343 PRP4YPR178W 1398 nt10.37□□□□□ -0.75
RVS161P25343 FEN2YCR028C 1539 nt10.36□□□□□ -0.75
RVS161P25343 WSC2YNL283C 1512 nt10.35□□□□□ -0.75
RVS161P25343 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.35□□□□□ -0.75
RVS161P25343 YEL076CYEL076C 651 nt10.35□□□□□ -0.75
RVS161P25343 YLR464WYLR464W 651 nt10.35□□□□□ -0.75
RVS161P25343 MRPL8YJL063C 717 nt10.32□□□□□ -0.76
RVS161P25343 AGP1YCL025C 1902 nt10.31□□□□□ -0.76
RVS161P25343 CCT4YDL143W 1587 nt10.31□□□□□ -0.76
RVS161P25343 DPS1YLL018C 1674 nt10.3□□□□□ -0.76
RVS161P25343 YIR016WYIR016W 798 nt10.29□□□□□ -0.76
RVS161P25343 TAD3YLR316C 969 nt10.29□□□□□ -0.76
RVS161P25343 AAC1YMR056C 930 nt10.29□□□□□ -0.76
RVS161P25343 VPS60YDR486C 690 nt10.28□□□□□ -0.76
RVS161P25343 HHO1YPL127C 777 nt10.28□□□□□ -0.76
RVS161P25343 HUA1YGR268C 597 nt10.27□□□□□ -0.77
RVS161P25343 SWC5YBR231C 912 nt10.26□□□□□ -0.77
RVS161P25343 YKR005CYKR005C 1578 nt10.26□□□□□ -0.77
RVS161P25343 YCL074WYCL074W 927 nt10.25□□□□□ -0.77
RVS161P25343 ADO1YJR105W 1023 nt10.25□□□□□ -0.77
RVS161P25343 BMT6YLR063W 1098 nt10.24□□□□□ -0.77
RVS161P25343 DUS1YML080W 1272 nt10.24□□□□□ -0.77
RVS161P25343 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.22□□□□□ -0.77
RVS161P25343 ALG3YBL082C 1377 nt10.22□□□□□ -0.77
RVS161P25343 YGR201CYGR201C 678 nt10.21□□□□□ -0.77
RVS161P25343 XDJ1YLR090W 1380 nt10.17□□□□□ -0.78
RVS161P25343 YGR259CYGR259C 441 nt10.16□□□□□ -0.78
RVS161P25343 SNF1YDR477W 1902 nt10.14□□□□□ -0.79
RVS161P25343 BDH1YAL060W 1149 nt10.13□□□□□ -0.79
RVS161P25343 YLR415CYLR415C 339 nt10.13□□□□□ -0.79
RVS161P25343 IRC24YIR036C 792 nt10.11□□□□□ -0.79
RVS161P25343 BIO5YNR056C 1686 nt10.11□□□□□ -0.79
RVS161P25343 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.1□□□□□ -0.79
RVS161P25343 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.1□□□□□ -0.79
RVS161P25343 STR3YGL184C 1398 nt10.1□□□□□ -0.79
RVS161P25343 DUT1YBR252W 444 nt10.09□□□□□ -0.79
RVS161P25343 NAR1YNL240C 1476 nt10.09□□□□□ -0.79
RVS161P25343 AVT6YER119C 1347 nt10.05□□□□□ -0.8
RVS161P25343 GOR1YNL274C 1053 nt10.04□□□□□ -0.8
RVS161P25343 GDH3YAL062W 1374 nt10.03□□□□□ -0.8
RVS161P25343 YSP3YOR003W 1437 nt10.03□□□□□ -0.8
RVS161P25343 TIM17YJL143W 477 nt10.01□□□□□ -0.81
RVS161P25343 PBP1YGR178C 2169 nt10.01□□□□□ -0.81
RVS161P25343 AQY2YLL052C 450 nt10□□□□□ -0.81
RVS161P25343 RPM1RPM1 483 nt10□□□□□ -0.81
RVS161P25343 CYT2YKL087C 675 nt9.97□□□□□ -0.81
RVS161P25343 PEX25YPL112C 1185 nt9.96□□□□□ -0.82
RVS161P25343 SHM2YLR058C 1410 nt9.96□□□□□ -0.82
RVS161P25343 RTN2YDL204W 1182 nt9.95□□□□□ -0.82
RVS161P25343 YNL115CYNL115C 1935 nt9.94□□□□□ -0.82
RVS161P25343 YFR018CYFR018C 1092 nt9.91□□□□□ -0.82
RVS161P25343 DAT1YML113W 747 nt9.89□□□□□ -0.83
RVS161P25343 VPS75YNL246W 795 nt9.89□□□□□ -0.83
RVS161P25343 NIT1YIL164C 600 nt9.86□□□□□ -0.83
RVS161P25343 YDR094WYDR094W 336 nt9.84□□□□□ -0.83
RVS161P25343 YCR102CYCR102C 1107 nt9.82□□□□□ -0.84
RVS161P25343 YFL066CYFL066C 1179 nt9.82□□□□□ -0.84
RVS161P25343 NBP35YGL091C 987 nt9.82□□□□□ -0.84
RVS161P25343 SGT2YOR007C 1041 nt9.82□□□□□ -0.84
RVS161P25343 HSL7YBR133C 2484 nt9.8□□□□□ -0.84
RVS161P25343 ARP6YLR085C 1317 nt9.79□□□□□ -0.84
RVS161P25343 PLB1YMR008C 1995 nt9.77□□□□□ -0.84
RVS161P25343 RRT5YFR032C 870 nt9.77□□□□□ -0.85
RVS161P25343 PAU7YAR020C 168 nt9.73□□□□□ -0.85
RVS161P25343 PRE6YOL038W 765 nt9.73□□□□□ -0.85
RVS161P25343 YAT1YAR035W 2064 nt9.7□□□□□ -0.86
RVS161P25343 CMP2YML057W 1815 nt9.7□□□□□ -0.86
RVS161P25343 PRM5YIL117C 957 nt9.68□□□□□ -0.86
RVS161P25343 HIF1YLL022C 1158 nt9.68□□□□□ -0.86
RVS161P25343 ALD4YOR374W 1560 nt9.67□□□□□ -0.86
RVS161P25343 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.65□□□□□ -0.86
RVS161P25343 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.65□□□□□ -0.86
RVS161P25343 LSC2YGR244C 1284 nt9.64□□□□□ -0.87
RVS161P25343 TIR3YIL011W 810 nt9.64□□□□□ -0.87
RVS161P25343 NDI1YML120C 1542 nt9.64□□□□□ -0.87
RVS161P25343 PAU16YKL224C 372 nt9.63□□□□□ -0.87
RVS161P25343 HEL2YDR266C 1920 nt9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms