Protein–RNA interactions for Protein: P22217

TRX1, Thioredoxin-1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRX1P22217 AHT1YHR093W 549 nt11.43□□□□□ -0.58
TRX1P22217 HEM12YDR047W 1089 nt11.42□□□□□ -0.58
TRX1P22217 NVJ2YPR091C 2313 nt11.42□□□□□ -0.58
TRX1P22217 YPR064WYPR064W 420 nt11.41□□□□□ -0.58
TRX1P22217 MIC10YCL057C-A 294 nt11.41□□□□□ -0.58
TRX1P22217 SNG1YGR197C 1644 nt11.4□□□□□ -0.58
TRX1P22217 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.4□□□□□ -0.58
TRX1P22217 STB1YNL309W 1263 nt11.39□□□□□ -0.59
TRX1P22217 SPC25YER018C 666 nt11.37□□□□□ -0.59
TRX1P22217 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.36□□□□□ -0.59
TRX1P22217 TAD3YLR316C 969 nt11.36□□□□□ -0.59
TRX1P22217 SPT8YLR055C 1809 nt11.34□□□□□ -0.59
TRX1P22217 ANP1YEL036C 1503 nt11.34□□□□□ -0.59
TRX1P22217 GPI16YHR188C 1833 nt11.31□□□□□ -0.6
TRX1P22217 CCT4YDL143W 1587 nt11.31□□□□□ -0.6
TRX1P22217 FEN2YCR028C 1539 nt11.3□□□□□ -0.6
TRX1P22217 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.29□□□□□ -0.6
TRX1P22217 VPS60YDR486C 690 nt11.28□□□□□ -0.6
TRX1P22217 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.28□□□□□ -0.6
TRX1P22217 PAC11YDR488C 1602 nt11.27□□□□□ -0.6
TRX1P22217 RAX1YOR301W 1308 nt11.23□□□□□ -0.61
TRX1P22217 ALG3YBL082C 1377 nt11.23□□□□□ -0.61
TRX1P22217 SWC5YBR231C 912 nt11.22□□□□□ -0.61
TRX1P22217 YIR016WYIR016W 798 nt11.21□□□□□ -0.61
TRX1P22217 BDH1YAL060W 1149 nt11.21□□□□□ -0.61
TRX1P22217 SWE1YJL187C 2460 nt11.19□□□□□ -0.62
TRX1P22217 BNA2YJR078W 1362 nt11.16□□□□□ -0.62
TRX1P22217 YLR415CYLR415C 339 nt11.15□□□□□ -0.62
TRX1P22217 MIC12YBR262C 321 nt11.13□□□□□ -0.63
TRX1P22217 YSP3YOR003W 1437 nt11.12□□□□□ -0.63
TRX1P22217 YDR094WYDR094W 336 nt11.09□□□□□ -0.63
TRX1P22217 UBX6YJL048C 1191 nt11.09□□□□□ -0.63
TRX1P22217 CCA1YER168C 1641 nt11.09□□□□□ -0.63
TRX1P22217 YFR018CYFR018C 1092 nt11.06□□□□□ -0.64
TRX1P22217 HHO1YPL127C 777 nt11.06□□□□□ -0.64
TRX1P22217 YFL066CYFL066C 1179 nt11.05□□□□□ -0.64
TRX1P22217 YNL115CYNL115C 1935 nt11.03□□□□□ -0.64
TRX1P22217 PEX25YPL112C 1185 nt11.03□□□□□ -0.64
TRX1P22217 PRE6YOL038W 765 nt11□□□□□ -0.65
TRX1P22217 XDJ1YLR090W 1380 nt10.99□□□□□ -0.65
TRX1P22217 AGP1YCL025C 1902 nt10.99□□□□□ -0.65
TRX1P22217 YGR201CYGR201C 678 nt10.97□□□□□ -0.65
TRX1P22217 SHM2YLR058C 1410 nt10.95□□□□□ -0.66
TRX1P22217 GDH3YAL062W 1374 nt10.95□□□□□ -0.66
TRX1P22217 TIM17YJL143W 477 nt10.94□□□□□ -0.66
TRX1P22217 RPM1RPM1 483 nt10.94□□□□□ -0.66
TRX1P22217 YJL225CYJL225C 5277 nt10.93□□□□□ -0.66
TRX1P22217 RRT5YFR032C 870 nt10.91□□□□□ -0.66
TRX1P22217 AVT6YER119C 1347 nt10.89□□□□□ -0.67
TRX1P22217 DUT1YBR252W 444 nt10.89□□□□□ -0.67
TRX1P22217 VPS75YNL246W 795 nt10.88□□□□□ -0.67
TRX1P22217 PAU16YKL224C 372 nt10.87□□□□□ -0.67
TRX1P22217 NIT1YIL164C 600 nt10.85□□□□□ -0.67
TRX1P22217 GOR1YNL274C 1053 nt10.85□□□□□ -0.67
TRX1P22217 FUR4YBR021W 1902 nt10.84□□□□□ -0.67
TRX1P22217 DUS1YML080W 1272 nt10.84□□□□□ -0.67
TRX1P22217 SGT2YOR007C 1041 nt10.81□□□□□ -0.68
TRX1P22217 YCL074WYCL074W 927 nt10.77□□□□□ -0.69
TRX1P22217 HSP60YLR259C 1719 nt10.75□□□□□ -0.69
TRX1P22217 STR3YGL184C 1398 nt10.75□□□□□ -0.69
TRX1P22217 GLK1YCL040W 1503 nt10.74□□□□□ -0.69
TRX1P22217 PAU7YAR020C 168 nt10.74□□□□□ -0.69
TRX1P22217 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.73□□□□□ -0.69
TRX1P22217 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.73□□□□□ -0.69
TRX1P22217 DAT1YML113W 747 nt10.73□□□□□ -0.69
TRX1P22217 BOR1YNL275W 1731 nt10.72□□□□□ -0.69
TRX1P22217 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.72□□□□□ -0.69
TRX1P22217 MIR1YJR077C 936 nt10.72□□□□□ -0.69
TRX1P22217 AQY2YLL052C 450 nt10.69□□□□□ -0.7
TRX1P22217 YCR102CYCR102C 1107 nt10.68□□□□□ -0.7
TRX1P22217 THI74YDR438W 1113 nt10.65□□□□□ -0.7
TRX1P22217 SHB17YKR043C 816 nt10.65□□□□□ -0.7
TRX1P22217 YDR010CYDR010C 333 nt10.64□□□□□ -0.71
TRX1P22217 NAT4YMR069W 858 nt10.64□□□□□ -0.71
TRX1P22217 NBP35YGL091C 987 nt10.63□□□□□ -0.71
TRX1P22217 PRP4YPR178W 1398 nt10.62□□□□□ -0.71
TRX1P22217 YKR005CYKR005C 1578 nt10.6□□□□□ -0.71
TRX1P22217 UBA4YHR111W 1323 nt10.59□□□□□ -0.71
TRX1P22217 MSF1YPR047W 1410 nt10.59□□□□□ -0.71
TRX1P22217 YGR259CYGR259C 441 nt10.56□□□□□ -0.72
TRX1P22217 DPS1YLL018C 1674 nt10.56□□□□□ -0.72
TRX1P22217 RET2YFR051C 1641 nt10.53□□□□□ -0.72
TRX1P22217 SHH4YLR164W 507 nt10.52□□□□□ -0.73
TRX1P22217 YSR3YKR053C 1215 nt10.51□□□□□ -0.73
TRX1P22217 PHO89YBR296C 1725 nt10.5□□□□□ -0.73
TRX1P22217 SFA1YDL168W 1161 nt10.5□□□□□ -0.73
TRX1P22217 BMT6YLR063W 1098 nt10.5□□□□□ -0.73
TRX1P22217 RTN2YDL204W 1182 nt10.49□□□□□ -0.73
TRX1P22217 TIR3YIL011W 810 nt10.49□□□□□ -0.73
TRX1P22217 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.48□□□□□ -0.73
TRX1P22217 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.48□□□□□ -0.73
TRX1P22217 YGL034CYGL034C 366 nt10.47□□□□□ -0.73
TRX1P22217 XYL2YLR070C 1071 nt10.47□□□□□ -0.73
TRX1P22217 ARP6YLR085C 1317 nt10.46□□□□□ -0.73
TRX1P22217 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.45□□□□□ -0.74
TRX1P22217 FRE6YLL051C 2139 nt10.45□□□□□ -0.74
TRX1P22217 AAC1YMR056C 930 nt10.44□□□□□ -0.74
TRX1P22217 PLB1YMR008C 1995 nt10.43□□□□□ -0.74
TRX1P22217 LSC2YGR244C 1284 nt10.42□□□□□ -0.74
TRX1P22217 POM34YLR018C 900 nt10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.1 ms