Protein–RNA interactions for Protein: P16872

Il7r, Interleukin-7 receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il7rP16872 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Il7rP16872 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Il7rP16872 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Il7rP16872 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Il7rP16872 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Il7rP16872 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Il7rP16872 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Il7rP16872 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Il7rP16872 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Il7rP16872 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Il7rP16872 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Il7rP16872 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Il7rP16872 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Il7rP16872 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Il7rP16872 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Il7rP16872 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Il7rP16872 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Il7rP16872 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Il7rP16872 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Il7rP16872 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Il7rP16872 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Il7rP16872 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Il7rP16872 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Il7rP16872 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Il7rP16872 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Il7rP16872 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Il7rP16872 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Il7rP16872 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Il7rP16872 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Il7rP16872 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Il7rP16872 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Il7rP16872 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Il7rP16872 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Il7rP16872 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Il7rP16872 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Il7rP16872 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Il7rP16872 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Il7rP16872 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Il7rP16872 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Il7rP16872 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Il7rP16872 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Il7rP16872 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Il7rP16872 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Il7rP16872 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Il7rP16872 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Il7rP16872 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Il7rP16872 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Il7rP16872 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Il7rP16872 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Il7rP16872 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Il7rP16872 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Il7rP16872 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Il7rP16872 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Il7rP16872 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Il7rP16872 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Il7rP16872 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Il7rP16872 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Il7rP16872 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Il7rP16872 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Il7rP16872 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Il7rP16872 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Il7rP16872 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Il7rP16872 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Il7rP16872 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Il7rP16872 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Il7rP16872 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Il7rP16872 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Il7rP16872 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Il7rP16872 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Il7rP16872 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Il7rP16872 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Il7rP16872 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Il7rP16872 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Il7rP16872 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Il7rP16872 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Il7rP16872 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Il7rP16872 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Il7rP16872 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Il7rP16872 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Il7rP16872 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Il7rP16872 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Il7rP16872 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Il7rP16872 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Il7rP16872 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Il7rP16872 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Il7rP16872 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Il7rP16872 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Il7rP16872 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Il7rP16872 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Il7rP16872 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Il7rP16872 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Il7rP16872 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Il7rP16872 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Il7rP16872 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Il7rP16872 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Il7rP16872 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Il7rP16872 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Il7rP16872 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Il7rP16872 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Il7rP16872 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms