Protein–RNA interactions for Protein: P11844

CRYGA, Gamma-crystallin A, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYGAP11844 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CRYGAP11844 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CRYGAP11844 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYGAP11844 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYGAP11844 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYGAP11844 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CRYGAP11844 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRYGAP11844 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CRYGAP11844 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRYGAP11844 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CRYGAP11844 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRYGAP11844 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CRYGAP11844 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYGAP11844 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYGAP11844 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYGAP11844 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CRYGAP11844 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRYGAP11844 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRYGAP11844 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRYGAP11844 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRYGAP11844 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRYGAP11844 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRYGAP11844 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRYGAP11844 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRYGAP11844 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRYGAP11844 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRYGAP11844 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CRYGAP11844 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRYGAP11844 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRYGAP11844 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CRYGAP11844 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRYGAP11844 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CRYGAP11844 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYGAP11844 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYGAP11844 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CRYGAP11844 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CRYGAP11844 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CRYGAP11844 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYGAP11844 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYGAP11844 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYGAP11844 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CRYGAP11844 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYGAP11844 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CRYGAP11844 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYGAP11844 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CRYGAP11844 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CRYGAP11844 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRYGAP11844 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CRYGAP11844 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYGAP11844 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYGAP11844 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CRYGAP11844 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYGAP11844 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYGAP11844 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYGAP11844 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYGAP11844 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CRYGAP11844 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYGAP11844 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CRYGAP11844 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYGAP11844 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYGAP11844 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYGAP11844 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CRYGAP11844 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms