Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtsbP10605 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtsbP10605 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtsbP10605 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtsbP10605 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtsbP10605 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtsbP10605 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtsbP10605 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtsbP10605 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtsbP10605 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtsbP10605 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtsbP10605 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtsbP10605 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtsbP10605 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CtsbP10605 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsbP10605 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CtsbP10605 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtsbP10605 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CtsbP10605 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtsbP10605 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CtsbP10605 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CtsbP10605 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtsbP10605 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsbP10605 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtsbP10605 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtsbP10605 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CtsbP10605 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsbP10605 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CtsbP10605 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtsbP10605 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsbP10605 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CtsbP10605 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtsbP10605 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CtsbP10605 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsbP10605 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsbP10605 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsbP10605 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsbP10605 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsbP10605 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsbP10605 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsbP10605 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsbP10605 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CtsbP10605 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsbP10605 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsbP10605 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsbP10605 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsbP10605 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsbP10605 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsbP10605 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsbP10605 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CtsbP10605 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsbP10605 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsbP10605 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsbP10605 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsbP10605 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsbP10605 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtsbP10605 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsbP10605 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsbP10605 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsbP10605 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsbP10605 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsbP10605 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsbP10605 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsbP10605 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsbP10605 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsbP10605 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsbP10605 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsbP10605 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsbP10605 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsbP10605 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsbP10605 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsbP10605 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsbP10605 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsbP10605 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsbP10605 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtsbP10605 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtsbP10605 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtsbP10605 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtsbP10605 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtsbP10605 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtsbP10605 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtsbP10605 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CtsbP10605 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtsbP10605 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CtsbP10605 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtsbP10605 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtsbP10605 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CtsbP10605 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsbP10605 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsbP10605 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CtsbP10605 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsbP10605 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CtsbP10605 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtsbP10605 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtsbP10605 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CtsbP10605 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsbP10605 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsbP10605 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CtsbP10605 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CtsbP10605 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms