Protein–RNA interactions for Protein: P0DP71

FAM236C, Protein FAM236C, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM236CP0DP71 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM236CP0DP71 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM236CP0DP71 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM236CP0DP71 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM236CP0DP71 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FAM236CP0DP71 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FAM236CP0DP71 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FAM236CP0DP71 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM236CP0DP71 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FAM236CP0DP71 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM236CP0DP71 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FAM236CP0DP71 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
FAM236CP0DP71 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
FAM236CP0DP71 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM236CP0DP71 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FAM236CP0DP71 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM236CP0DP71 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM236CP0DP71 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FAM236CP0DP71 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM236CP0DP71 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FAM236CP0DP71 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM236CP0DP71 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM236CP0DP71 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAM236CP0DP71 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM236CP0DP71 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM236CP0DP71 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAM236CP0DP71 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM236CP0DP71 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAM236CP0DP71 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAM236CP0DP71 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM236CP0DP71 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM236CP0DP71 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAM236CP0DP71 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM236CP0DP71 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FAM236CP0DP71 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM236CP0DP71 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM236CP0DP71 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM236CP0DP71 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM236CP0DP71 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM236CP0DP71 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM236CP0DP71 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM236CP0DP71 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM236CP0DP71 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM236CP0DP71 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM236CP0DP71 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM236CP0DP71 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM236CP0DP71 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM236CP0DP71 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM236CP0DP71 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM236CP0DP71 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM236CP0DP71 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM236CP0DP71 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM236CP0DP71 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM236CP0DP71 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM236CP0DP71 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM236CP0DP71 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM236CP0DP71 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM236CP0DP71 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM236CP0DP71 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM236CP0DP71 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM236CP0DP71 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM236CP0DP71 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FAM236CP0DP71 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM236CP0DP71 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM236CP0DP71 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM236CP0DP71 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM236CP0DP71 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FAM236CP0DP71 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM236CP0DP71 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM236CP0DP71 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FAM236CP0DP71 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM236CP0DP71 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM236CP0DP71 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM236CP0DP71 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FAM236CP0DP71 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FAM236CP0DP71 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM236CP0DP71 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM236CP0DP71 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAM236CP0DP71 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM236CP0DP71 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM236CP0DP71 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM236CP0DP71 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM236CP0DP71 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAM236CP0DP71 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM236CP0DP71 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM236CP0DP71 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM236CP0DP71 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM236CP0DP71 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM236CP0DP71 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM236CP0DP71 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM236CP0DP71 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM236CP0DP71 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM236CP0DP71 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM236CP0DP71 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM236CP0DP71 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM236CP0DP71 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM236CP0DP71 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM236CP0DP71 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM236CP0DP71 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM236CP0DP71 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms