Protein–RNA interactions for Protein: P0CX24

RPL20B, 60S ribosomal protein L20-B, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL20BP0CX24 LYS4YDR234W 2082 nt10.07□□□□□ -0.8
RPL20BP0CX24 CRR1YLR213C 1269 nt10.07□□□□□ -0.8
RPL20BP0CX24 YDR094WYDR094W 336 nt10.06□□□□□ -0.8
RPL20BP0CX24 YFL067WYFL067W 528 nt10.05□□□□□ -0.8
RPL20BP0CX24 DDR2YOL052C-A 186 nt10.04□□□□□ -0.8
RPL20BP0CX24 STB1YNL309W 1263 nt10.03□□□□□ -0.8
RPL20BP0CX24 SPC25YER018C 666 nt10.01□□□□□ -0.81
RPL20BP0CX24 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.99□□□□□ -0.81
RPL20BP0CX24 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.99□□□□□ -0.81
RPL20BP0CX24 CCT4YDL143W 1587 nt9.97□□□□□ -0.81
RPL20BP0CX24 HEM12YDR047W 1089 nt9.97□□□□□ -0.81
RPL20BP0CX24 GPI16YHR188C 1833 nt9.97□□□□□ -0.81
RPL20BP0CX24 SNG1YGR197C 1644 nt9.96□□□□□ -0.81
RPL20BP0CX24 MIC10YCL057C-A 294 nt9.95□□□□□ -0.82
RPL20BP0CX24 ANP1YEL036C 1503 nt9.95□□□□□ -0.82
RPL20BP0CX24 YFR018CYFR018C 1092 nt9.93□□□□□ -0.82
RPL20BP0CX24 BDH1YAL060W 1149 nt9.93□□□□□ -0.82
RPL20BP0CX24 FEN2YCR028C 1539 nt9.92□□□□□ -0.82
RPL20BP0CX24 YFL054CYFL054C 1941 nt9.92□□□□□ -0.82
RPL20BP0CX24 VPS60YDR486C 690 nt9.92□□□□□ -0.82
RPL20BP0CX24 SWC5YBR231C 912 nt9.9□□□□□ -0.82
RPL20BP0CX24 YLR415CYLR415C 339 nt9.89□□□□□ -0.83
RPL20BP0CX24 YSP3YOR003W 1437 nt9.88□□□□□ -0.83
RPL20BP0CX24 ALG3YBL082C 1377 nt9.88□□□□□ -0.83
RPL20BP0CX24 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.86□□□□□ -0.83
RPL20BP0CX24 PRE6YOL038W 765 nt9.85□□□□□ -0.83
RPL20BP0CX24 SPT8YLR055C 1809 nt9.84□□□□□ -0.83
RPL20BP0CX24 PEX25YPL112C 1185 nt9.84□□□□□ -0.83
RPL20BP0CX24 YFL066CYFL066C 1179 nt9.83□□□□□ -0.84
RPL20BP0CX24 YIR016WYIR016W 798 nt9.83□□□□□ -0.84
RPL20BP0CX24 RRT5YFR032C 870 nt9.82□□□□□ -0.84
RPL20BP0CX24 PAU16YKL224C 372 nt9.81□□□□□ -0.84
RPL20BP0CX24 YNL115CYNL115C 1935 nt9.81□□□□□ -0.84
RPL20BP0CX24 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.79□□□□□ -0.84
RPL20BP0CX24 RAX1YOR301W 1308 nt9.78□□□□□ -0.84
RPL20BP0CX24 BNA2YJR078W 1362 nt9.76□□□□□ -0.85
RPL20BP0CX24 PAC11YDR488C 1602 nt9.74□□□□□ -0.85
RPL20BP0CX24 MIC12YBR262C 321 nt9.74□□□□□ -0.85
RPL20BP0CX24 SWE1YJL187C 2460 nt9.74□□□□□ -0.85
RPL20BP0CX24 YJL225CYJL225C 5277 nt9.73□□□□□ -0.85
RPL20BP0CX24 VPS75YNL246W 795 nt9.69□□□□□ -0.86
RPL20BP0CX24 TIM17YJL143W 477 nt9.67□□□□□ -0.86
RPL20BP0CX24 XDJ1YLR090W 1380 nt9.66□□□□□ -0.86
RPL20BP0CX24 HHO1YPL127C 777 nt9.65□□□□□ -0.86
RPL20BP0CX24 SHM2YLR058C 1410 nt9.65□□□□□ -0.87
RPL20BP0CX24 CCA1YER168C 1641 nt9.64□□□□□ -0.87
RPL20BP0CX24 YGR201CYGR201C 678 nt9.62□□□□□ -0.87
RPL20BP0CX24 GDH3YAL062W 1374 nt9.61□□□□□ -0.87
RPL20BP0CX24 MIR1YJR077C 936 nt9.59□□□□□ -0.87
RPL20BP0CX24 NAT4YMR069W 858 nt9.58□□□□□ -0.88
RPL20BP0CX24 GLK1YCL040W 1503 nt9.57□□□□□ -0.88
RPL20BP0CX24 NIT1YIL164C 600 nt9.56□□□□□ -0.88
RPL20BP0CX24 AGP1YCL025C 1902 nt9.56□□□□□ -0.88
RPL20BP0CX24 THI74YDR438W 1113 nt9.54□□□□□ -0.88
RPL20BP0CX24 PAU7YAR020C 168 nt9.54□□□□□ -0.88
RPL20BP0CX24 SGT2YOR007C 1041 nt9.54□□□□□ -0.88
RPL20BP0CX24 AVT6YER119C 1347 nt9.54□□□□□ -0.88
RPL20BP0CX24 MSF1YPR047W 1410 nt9.51□□□□□ -0.89
RPL20BP0CX24 GOR1YNL274C 1053 nt9.49□□□□□ -0.89
RPL20BP0CX24 DUT1YBR252W 444 nt9.48□□□□□ -0.89
RPL20BP0CX24 SHB17YKR043C 816 nt9.47□□□□□ -0.89
RPL20BP0CX24 DAT1YML113W 747 nt9.46□□□□□ -0.9
RPL20BP0CX24 UBA4YHR111W 1323 nt9.45□□□□□ -0.9
RPL20BP0CX24 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.45□□□□□ -0.9
RPL20BP0CX24 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.45□□□□□ -0.9
RPL20BP0CX24 YDR010CYDR010C 333 nt9.44□□□□□ -0.9
RPL20BP0CX24 SBA1YKL117W 651 nt9.42□□□□□ -0.9
RPL20BP0CX24 FUR4YBR021W 1902 nt9.42□□□□□ -0.9
RPL20BP0CX24 DUS1YML080W 1272 nt9.41□□□□□ -0.9
RPL20BP0CX24 YCR102CYCR102C 1107 nt9.39□□□□□ -0.91
RPL20BP0CX24 YSR3YKR053C 1215 nt9.38□□□□□ -0.91
RPL20BP0CX24 YGL034CYGL034C 366 nt9.37□□□□□ -0.91
RPL20BP0CX24 RET2YFR051C 1641 nt9.36□□□□□ -0.91
RPL20BP0CX24 YCL074WYCL074W 927 nt9.35□□□□□ -0.91
RPL20BP0CX24 STR3YGL184C 1398 nt9.35□□□□□ -0.91
RPL20BP0CX24 HSP60YLR259C 1719 nt9.34□□□□□ -0.92
RPL20BP0CX24 PHO89YBR296C 1725 nt9.34□□□□□ -0.92
RPL20BP0CX24 XYL2YLR070C 1071 nt9.32□□□□□ -0.92
RPL20BP0CX24 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.32□□□□□ -0.92
RPL20BP0CX24 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.32□□□□□ -0.92
RPL20BP0CX24 NBP35YGL091C 987 nt9.31□□□□□ -0.92
RPL20BP0CX24 AQY2YLL052C 450 nt9.3□□□□□ -0.92
RPL20BP0CX24 YCR087WYCR087W 516 nt9.28□□□□□ -0.92
RPL20BP0CX24 BOR1YNL275W 1731 nt9.28□□□□□ -0.92
RPL20BP0CX24 SFA1YDL168W 1161 nt9.27□□□□□ -0.93
RPL20BP0CX24 TIR3YIL011W 810 nt9.24□□□□□ -0.93
RPL20BP0CX24 RBG1YAL036C 1110 nt9.24□□□□□ -0.93
RPL20BP0CX24 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.23□□□□□ -0.93
RPL20BP0CX24 SHH4YLR164W 507 nt9.23□□□□□ -0.93
RPL20BP0CX24 COQ2YNR041C 1119 nt9.23□□□□□ -0.93
RPL20BP0CX24 AIM45YPR004C 1035 nt9.23□□□□□ -0.93
RPL20BP0CX24 MRP20YDR405W 792 nt9.22□□□□□ -0.93
RPL20BP0CX24 PRP4YPR178W 1398 nt9.22□□□□□ -0.93
RPL20BP0CX24 NDI1YML120C 1542 nt9.21□□□□□ -0.93
RPL20BP0CX24 YKR005CYKR005C 1578 nt9.21□□□□□ -0.93
RPL20BP0CX24 NVJ2YPR091C 2313 nt9.21□□□□□ -0.94
RPL20BP0CX24 GLR1YPL091W 1452 nt9.18□□□□□ -0.94
RPL20BP0CX24 YGR259CYGR259C 441 nt9.17□□□□□ -0.94
RPL20BP0CX24 YMR244WYMR244W 1068 nt9.17□□□□□ -0.94
RPL20BP0CX24 LSC2YGR244C 1284 nt9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.8 ms