Protein–RNA interactions for Protein: P08004

CHS1, Chitin synthase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CHS1P08004 PRE6YOL038W 765 nt11.53□□□□□ -0.56
CHS1P08004 DDR2YOL052C-A 186 nt11.53□□□□□ -0.56
CHS1P08004 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.52□□□□□ -0.57
CHS1P08004 CRR1YLR213C 1269 nt11.52□□□□□ -0.57
CHS1P08004 BOP3YNL042W 1191 nt11.52□□□□□ -0.57
CHS1P08004 SPC25YER018C 666 nt11.51□□□□□ -0.57
CHS1P08004 YFL067WYFL067W 528 nt11.51□□□□□ -0.57
CHS1P08004 LYS4YDR234W 2082 nt11.51□□□□□ -0.57
CHS1P08004 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.5□□□□□ -0.57
CHS1P08004 PAU16YKL224C 372 nt11.49□□□□□ -0.57
CHS1P08004 BDH1YAL060W 1149 nt11.48□□□□□ -0.57
CHS1P08004 CCT4YDL143W 1587 nt11.48□□□□□ -0.57
CHS1P08004 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.46□□□□□ -0.57
CHS1P08004 YFL066CYFL066C 1179 nt11.46□□□□□ -0.57
CHS1P08004 PAC11YDR488C 1602 nt11.45□□□□□ -0.58
CHS1P08004 GPI16YHR188C 1833 nt11.44□□□□□ -0.58
CHS1P08004 VPS60YDR486C 690 nt11.44□□□□□ -0.58
CHS1P08004 RRT5YFR032C 870 nt11.44□□□□□ -0.58
CHS1P08004 SNG1YGR197C 1644 nt11.43□□□□□ -0.58
CHS1P08004 MIC10YCL057C-A 294 nt11.43□□□□□ -0.58
CHS1P08004 NVJ2YPR091C 2313 nt11.43□□□□□ -0.58
CHS1P08004 YSP3YOR003W 1437 nt11.43□□□□□ -0.58
CHS1P08004 FEN2YCR028C 1539 nt11.41□□□□□ -0.58
CHS1P08004 ANP1YEL036C 1503 nt11.41□□□□□ -0.58
CHS1P08004 HEM12YDR047W 1089 nt11.41□□□□□ -0.58
CHS1P08004 YLR415CYLR415C 339 nt11.41□□□□□ -0.58
CHS1P08004 PEX25YPL112C 1185 nt11.4□□□□□ -0.58
CHS1P08004 SWC5YBR231C 912 nt11.4□□□□□ -0.58
CHS1P08004 ALG3YBL082C 1377 nt11.4□□□□□ -0.59
CHS1P08004 PTK1YKL198C 1989 nt11.38□□□□□ -0.59
CHS1P08004 YNL115CYNL115C 1935 nt11.38□□□□□ -0.59
CHS1P08004 YIR016WYIR016W 798 nt11.31□□□□□ -0.6
CHS1P08004 Q0182Q0182 405 nt11.27□□□□□ -0.61
CHS1P08004 SPT8YLR055C 1809 nt11.24□□□□□ -0.61
CHS1P08004 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.24□□□□□ -0.61
CHS1P08004 YFL054CYFL054C 1941 nt11.2□□□□□ -0.62
CHS1P08004 BNA2YJR078W 1362 nt11.18□□□□□ -0.62
CHS1P08004 VPS75YNL246W 795 nt11.18□□□□□ -0.62
CHS1P08004 RAX1YOR301W 1308 nt11.16□□□□□ -0.62
CHS1P08004 NAT4YMR069W 858 nt11.16□□□□□ -0.62
CHS1P08004 GLK1YCL040W 1503 nt11.14□□□□□ -0.63
CHS1P08004 MIR1YJR077C 936 nt11.14□□□□□ -0.63
CHS1P08004 SBA1YKL117W 651 nt11.14□□□□□ -0.63
CHS1P08004 MIC12YBR262C 321 nt11.14□□□□□ -0.63
CHS1P08004 TIM17YJL143W 477 nt11.13□□□□□ -0.63
CHS1P08004 SHM2YLR058C 1410 nt11.12□□□□□ -0.63
CHS1P08004 XDJ1YLR090W 1380 nt11.12□□□□□ -0.63
CHS1P08004 THI74YDR438W 1113 nt11.09□□□□□ -0.63
CHS1P08004 MSF1YPR047W 1410 nt11.08□□□□□ -0.64
CHS1P08004 HHO1YPL127C 777 nt11.06□□□□□ -0.64
CHS1P08004 GDH3YAL062W 1374 nt11.05□□□□□ -0.64
CHS1P08004 PAU7YAR020C 168 nt11.05□□□□□ -0.64
CHS1P08004 NIT1YIL164C 600 nt11.02□□□□□ -0.65
CHS1P08004 SGT2YOR007C 1041 nt11.01□□□□□ -0.65
CHS1P08004 YGR201CYGR201C 678 nt11□□□□□ -0.65
CHS1P08004 DAT1YML113W 747 nt11□□□□□ -0.65
CHS1P08004 SHB17YKR043C 816 nt10.97□□□□□ -0.65
CHS1P08004 CCA1YER168C 1641 nt10.97□□□□□ -0.65
CHS1P08004 AGP1YCL025C 1902 nt10.96□□□□□ -0.66
CHS1P08004 SWE1YJL187C 2460 nt10.95□□□□□ -0.66
CHS1P08004 AVT6YER119C 1347 nt10.95□□□□□ -0.66
CHS1P08004 UBA4YHR111W 1323 nt10.95□□□□□ -0.66
CHS1P08004 DUT1YBR252W 444 nt10.93□□□□□ -0.66
CHS1P08004 YDR010CYDR010C 333 nt10.92□□□□□ -0.66
CHS1P08004 YGL034CYGL034C 366 nt10.9□□□□□ -0.66
CHS1P08004 GOR1YNL274C 1053 nt10.89□□□□□ -0.67
CHS1P08004 YSR3YKR053C 1215 nt10.88□□□□□ -0.67
CHS1P08004 XYL2YLR070C 1071 nt10.85□□□□□ -0.67
CHS1P08004 PHO89YBR296C 1725 nt10.82□□□□□ -0.68
CHS1P08004 RET2YFR051C 1641 nt10.82□□□□□ -0.68
CHS1P08004 YCR102CYCR102C 1107 nt10.78□□□□□ -0.68
CHS1P08004 RBG1YAL036C 1110 nt10.76□□□□□ -0.69
CHS1P08004 DUS1YML080W 1272 nt10.76□□□□□ -0.69
CHS1P08004 YMR244WYMR244W 1068 nt10.75□□□□□ -0.69
CHS1P08004 NDI1YML120C 1542 nt10.74□□□□□ -0.69
CHS1P08004 YCR087WYCR087W 516 nt10.72□□□□□ -0.69
CHS1P08004 SFA1YDL168W 1161 nt10.72□□□□□ -0.69
CHS1P08004 GLR1YPL091W 1452 nt10.72□□□□□ -0.69
CHS1P08004 AIM45YPR004C 1035 nt10.7□□□□□ -0.7
CHS1P08004 COQ2YNR041C 1119 nt10.69□□□□□ -0.7
CHS1P08004 STR3YGL184C 1398 nt10.68□□□□□ -0.7
CHS1P08004 NBP35YGL091C 987 nt10.68□□□□□ -0.7
CHS1P08004 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.68□□□□□ -0.7
CHS1P08004 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.68□□□□□ -0.7
CHS1P08004 MRP20YDR405W 792 nt10.67□□□□□ -0.7
CHS1P08004 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.67□□□□□ -0.7
CHS1P08004 AQY2YLL052C 450 nt10.67□□□□□ -0.7
CHS1P08004 SHH4YLR164W 507 nt10.67□□□□□ -0.7
CHS1P08004 YCL074WYCL074W 927 nt10.63□□□□□ -0.71
CHS1P08004 TIR3YIL011W 810 nt10.6□□□□□ -0.71
CHS1P08004 FUR4YBR021W 1902 nt10.58□□□□□ -0.72
CHS1P08004 TOM6YOR045W 186 nt10.57□□□□□ -0.72
CHS1P08004 RBG2YGR173W 1107 nt10.53□□□□□ -0.72
CHS1P08004 POM34YLR018C 900 nt10.53□□□□□ -0.72
CHS1P08004 RPL4BYDR012W 1089 nt10.52□□□□□ -0.73
CHS1P08004 RPL4AYBR031W 1089 nt10.52□□□□□ -0.73
CHS1P08004 PRO1YDR300C 1287 nt10.51□□□□□ -0.73
CHS1P08004 PEX2YJL210W 816 nt10.5□□□□□ -0.73
CHS1P08004 RPS14BYJL191W 417 nt10.48□□□□□ -0.73
CHS1P08004 UME6YDR207C 2511 nt10.48□□□□□ -0.73
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