Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Hoxa7P02830 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Hoxa7P02830 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Hoxa7P02830 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Hoxa7P02830 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Hoxa7P02830 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Hoxa7P02830 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Hoxa7P02830 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Hoxa7P02830 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Hoxa7P02830 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Hoxa7P02830 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Hoxa7P02830 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Hoxa7P02830 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Hoxa7P02830 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Hoxa7P02830 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Hoxa7P02830 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Hoxa7P02830 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Hoxa7P02830 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Hoxa7P02830 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Hoxa7P02830 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Hoxa7P02830 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Hoxa7P02830 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Hoxa7P02830 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Hoxa7P02830 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Hoxa7P02830 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Hoxa7P02830 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Hoxa7P02830 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hoxa7P02830 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hoxa7P02830 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Hoxa7P02830 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Hoxa7P02830 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Hoxa7P02830 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Hoxa7P02830 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Hoxa7P02830 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Hoxa7P02830 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Hoxa7P02830 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Hoxa7P02830 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Hoxa7P02830 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Hoxa7P02830 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Hoxa7P02830 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Hoxa7P02830 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Hoxa7P02830 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Hoxa7P02830 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Hoxa7P02830 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Hoxa7P02830 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Hoxa7P02830 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Hoxa7P02830 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Hoxa7P02830 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Hoxa7P02830 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Hoxa7P02830 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Hoxa7P02830 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Hoxa7P02830 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Hoxa7P02830 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Hoxa7P02830 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Hoxa7P02830 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Hoxa7P02830 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Hoxa7P02830 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Hoxa7P02830 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Hoxa7P02830 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Hoxa7P02830 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Hoxa7P02830 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Hoxa7P02830 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Hoxa7P02830 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Hoxa7P02830 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Hoxa7P02830 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Hoxa7P02830 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Hoxa7P02830 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Hoxa7P02830 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Hoxa7P02830 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Hoxa7P02830 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Hoxa7P02830 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Hoxa7P02830 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Hoxa7P02830 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Hoxa7P02830 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Hoxa7P02830 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Hoxa7P02830 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hoxa7P02830 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hoxa7P02830 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hoxa7P02830 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hoxa7P02830 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Hoxa7P02830 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Hoxa7P02830 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Hoxa7P02830 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Hoxa7P02830 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Hoxa7P02830 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Hoxa7P02830 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Hoxa7P02830 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Hoxa7P02830 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Hoxa7P02830 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Hoxa7P02830 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Hoxa7P02830 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Hoxa7P02830 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Hoxa7P02830 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Hoxa7P02830 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Hoxa7P02830 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Hoxa7P02830 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Hoxa7P02830 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Hoxa7P02830 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Hoxa7P02830 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Hoxa7P02830 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms