Protein–RNA interactions for Protein: O55060

Tpmt, Thiopurine S-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpmtO55060 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TpmtO55060 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TpmtO55060 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TpmtO55060 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TpmtO55060 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TpmtO55060 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TpmtO55060 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TpmtO55060 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TpmtO55060 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TpmtO55060 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TpmtO55060 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TpmtO55060 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TpmtO55060 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TpmtO55060 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TpmtO55060 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TpmtO55060 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TpmtO55060 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TpmtO55060 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TpmtO55060 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TpmtO55060 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TpmtO55060 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TpmtO55060 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TpmtO55060 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TpmtO55060 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TpmtO55060 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TpmtO55060 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TpmtO55060 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TpmtO55060 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TpmtO55060 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TpmtO55060 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TpmtO55060 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TpmtO55060 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TpmtO55060 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TpmtO55060 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TpmtO55060 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TpmtO55060 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TpmtO55060 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TpmtO55060 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TpmtO55060 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TpmtO55060 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TpmtO55060 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TpmtO55060 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TpmtO55060 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TpmtO55060 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TpmtO55060 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TpmtO55060 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TpmtO55060 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TpmtO55060 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TpmtO55060 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TpmtO55060 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TpmtO55060 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TpmtO55060 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TpmtO55060 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TpmtO55060 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TpmtO55060 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TpmtO55060 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TpmtO55060 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TpmtO55060 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TpmtO55060 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TpmtO55060 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TpmtO55060 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TpmtO55060 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TpmtO55060 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TpmtO55060 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TpmtO55060 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TpmtO55060 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TpmtO55060 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TpmtO55060 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TpmtO55060 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TpmtO55060 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TpmtO55060 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TpmtO55060 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TpmtO55060 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TpmtO55060 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TpmtO55060 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TpmtO55060 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TpmtO55060 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TpmtO55060 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TpmtO55060 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TpmtO55060 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TpmtO55060 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TpmtO55060 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TpmtO55060 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TpmtO55060 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TpmtO55060 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TpmtO55060 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TpmtO55060 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TpmtO55060 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TpmtO55060 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TpmtO55060 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TpmtO55060 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TpmtO55060 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TpmtO55060 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TpmtO55060 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TpmtO55060 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TpmtO55060 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TpmtO55060 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TpmtO55060 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TpmtO55060 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TpmtO55060 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms