Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Limk2O54785 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Limk2O54785 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Limk2O54785 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Limk2O54785 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Limk2O54785 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Limk2O54785 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Limk2O54785 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Limk2O54785 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Limk2O54785 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Limk2O54785 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Limk2O54785 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Limk2O54785 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Limk2O54785 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Limk2O54785 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Limk2O54785 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Limk2O54785 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Limk2O54785 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Limk2O54785 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Limk2O54785 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Limk2O54785 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Limk2O54785 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Limk2O54785 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Limk2O54785 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Limk2O54785 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Limk2O54785 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Limk2O54785 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Limk2O54785 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Limk2O54785 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Limk2O54785 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Limk2O54785 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Limk2O54785 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Limk2O54785 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Limk2O54785 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Limk2O54785 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Limk2O54785 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Limk2O54785 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Limk2O54785 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Limk2O54785 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Limk2O54785 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Limk2O54785 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Limk2O54785 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Limk2O54785 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Limk2O54785 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Limk2O54785 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Limk2O54785 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Limk2O54785 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Limk2O54785 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Limk2O54785 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Limk2O54785 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Limk2O54785 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Limk2O54785 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Limk2O54785 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Limk2O54785 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Limk2O54785 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Limk2O54785 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Limk2O54785 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Limk2O54785 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Limk2O54785 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Limk2O54785 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Limk2O54785 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Limk2O54785 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Limk2O54785 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Limk2O54785 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Limk2O54785 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Limk2O54785 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Limk2O54785 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Limk2O54785 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Limk2O54785 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Limk2O54785 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Limk2O54785 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Limk2O54785 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Limk2O54785 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Limk2O54785 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Limk2O54785 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Limk2O54785 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Limk2O54785 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Limk2O54785 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Limk2O54785 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Limk2O54785 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Limk2O54785 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Limk2O54785 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Limk2O54785 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Limk2O54785 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Limk2O54785 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Limk2O54785 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Limk2O54785 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Limk2O54785 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Limk2O54785 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Limk2O54785 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Limk2O54785 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Limk2O54785 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Limk2O54785 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Limk2O54785 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Limk2O54785 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Limk2O54785 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Limk2O54785 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Limk2O54785 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Limk2O54785 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Limk2O54785 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms