Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sp100O35892 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sp100O35892 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp100O35892 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp100O35892 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp100O35892 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sp100O35892 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sp100O35892 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp100O35892 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp100O35892 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sp100O35892 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sp100O35892 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sp100O35892 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sp100O35892 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sp100O35892 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sp100O35892 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp100O35892 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sp100O35892 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sp100O35892 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sp100O35892 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp100O35892 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp100O35892 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp100O35892 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sp100O35892 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp100O35892 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp100O35892 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp100O35892 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sp100O35892 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sp100O35892 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sp100O35892 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sp100O35892 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sp100O35892 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp100O35892 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sp100O35892 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp100O35892 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sp100O35892 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp100O35892 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp100O35892 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sp100O35892 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sp100O35892 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp100O35892 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sp100O35892 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sp100O35892 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp100O35892 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp100O35892 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sp100O35892 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp100O35892 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp100O35892 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sp100O35892 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp100O35892 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp100O35892 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp100O35892 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sp100O35892 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Sp100O35892 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sp100O35892 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sp100O35892 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sp100O35892 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp100O35892 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp100O35892 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp100O35892 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp100O35892 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp100O35892 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp100O35892 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp100O35892 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp100O35892 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp100O35892 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp100O35892 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp100O35892 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp100O35892 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sp100O35892 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sp100O35892 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sp100O35892 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sp100O35892 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sp100O35892 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sp100O35892 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sp100O35892 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sp100O35892 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sp100O35892 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sp100O35892 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp100O35892 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp100O35892 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp100O35892 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp100O35892 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp100O35892 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp100O35892 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sp100O35892 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sp100O35892 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sp100O35892 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sp100O35892 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp100O35892 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp100O35892 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sp100O35892 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sp100O35892 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sp100O35892 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sp100O35892 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sp100O35892 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp100O35892 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp100O35892 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp100O35892 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp100O35892 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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