Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Stag2O35638 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Stag2O35638 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Stag2O35638 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Stag2O35638 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Stag2O35638 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Stag2O35638 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Stag2O35638 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Stag2O35638 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Stag2O35638 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Stag2O35638 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Stag2O35638 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Stag2O35638 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Stag2O35638 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Stag2O35638 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Stag2O35638 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30,36■■■□□ 2,45
Stag2O35638 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Stag2O35638 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Stag2O35638 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Stag2O35638 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Stag2O35638 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Stag2O35638 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Stag2O35638 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Stag2O35638 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Stag2O35638 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Stag2O35638 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Stag2O35638 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Stag2O35638 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30,2■■■□□ 2,42
Stag2O35638 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Stag2O35638 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Stag2O35638 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Stag2O35638 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Stag2O35638 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Stag2O35638 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Stag2O35638 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Stag2O35638 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Stag2O35638 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Stag2O35638 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
Stag2O35638 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Stag2O35638 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Stag2O35638 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Stag2O35638 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Stag2O35638 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Stag2O35638 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Stag2O35638 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Stag2O35638 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Stag2O35638 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Stag2O35638 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Stag2O35638 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Stag2O35638 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Stag2O35638 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Stag2O35638 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Stag2O35638 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Stag2O35638 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Stag2O35638 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Stag2O35638 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Stag2O35638 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Stag2O35638 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Stag2O35638 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Stag2O35638 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Stag2O35638 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,85■■■□□ 2,37
Stag2O35638 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Stag2O35638 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Stag2O35638 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Stag2O35638 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Stag2O35638 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Stag2O35638 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Stag2O35638 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Stag2O35638 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Stag2O35638 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Stag2O35638 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Stag2O35638 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Stag2O35638 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Stag2O35638 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Stag2O35638 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Stag2O35638 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Stag2O35638 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Stag2O35638 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Stag2O35638 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Stag2O35638 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Stag2O35638 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Stag2O35638 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Stag2O35638 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Stag2O35638 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29,65■■■□□ 2,34
Stag2O35638 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Stag2O35638 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Stag2O35638 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Stag2O35638 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Stag2O35638 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Stag2O35638 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Stag2O35638 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Stag2O35638 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Stag2O35638 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Stag2O35638 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Stag2O35638 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Stag2O35638 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Stag2O35638 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Stag2O35638 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Stag2O35638 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Stag2O35638 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms