Protein–RNA interactions for Protein: O35257

Prl6a1, Prolactin-6A1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl6a1O35257 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Prl6a1O35257 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Prl6a1O35257 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prl6a1O35257 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prl6a1O35257 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prl6a1O35257 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Prl6a1O35257 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Prl6a1O35257 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prl6a1O35257 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prl6a1O35257 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prl6a1O35257 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Prl6a1O35257 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Prl6a1O35257 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prl6a1O35257 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prl6a1O35257 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prl6a1O35257 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prl6a1O35257 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prl6a1O35257 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prl6a1O35257 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prl6a1O35257 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prl6a1O35257 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prl6a1O35257 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prl6a1O35257 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prl6a1O35257 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prl6a1O35257 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prl6a1O35257 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prl6a1O35257 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prl6a1O35257 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prl6a1O35257 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prl6a1O35257 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Prl6a1O35257 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Prl6a1O35257 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prl6a1O35257 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prl6a1O35257 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prl6a1O35257 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prl6a1O35257 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prl6a1O35257 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prl6a1O35257 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prl6a1O35257 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prl6a1O35257 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prl6a1O35257 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prl6a1O35257 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prl6a1O35257 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prl6a1O35257 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prl6a1O35257 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prl6a1O35257 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prl6a1O35257 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prl6a1O35257 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prl6a1O35257 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prl6a1O35257 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prl6a1O35257 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prl6a1O35257 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prl6a1O35257 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prl6a1O35257 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prl6a1O35257 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prl6a1O35257 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prl6a1O35257 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prl6a1O35257 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prl6a1O35257 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prl6a1O35257 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prl6a1O35257 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prl6a1O35257 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prl6a1O35257 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prl6a1O35257 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prl6a1O35257 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prl6a1O35257 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prl6a1O35257 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prl6a1O35257 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prl6a1O35257 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prl6a1O35257 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prl6a1O35257 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prl6a1O35257 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prl6a1O35257 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Prl6a1O35257 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prl6a1O35257 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prl6a1O35257 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prl6a1O35257 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Prl6a1O35257 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prl6a1O35257 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Prl6a1O35257 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prl6a1O35257 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prl6a1O35257 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prl6a1O35257 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prl6a1O35257 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Prl6a1O35257 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Prl6a1O35257 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prl6a1O35257 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Prl6a1O35257 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prl6a1O35257 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prl6a1O35257 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prl6a1O35257 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Prl6a1O35257 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prl6a1O35257 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prl6a1O35257 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prl6a1O35257 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Prl6a1O35257 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prl6a1O35257 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prl6a1O35257 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prl6a1O35257 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Prl6a1O35257 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms