Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sema4dO09126 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sema4dO09126 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sema4dO09126 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sema4dO09126 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sema4dO09126 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sema4dO09126 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sema4dO09126 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sema4dO09126 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sema4dO09126 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sema4dO09126 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Sema4dO09126 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sema4dO09126 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sema4dO09126 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sema4dO09126 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sema4dO09126 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sema4dO09126 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sema4dO09126 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema4dO09126 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema4dO09126 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Sema4dO09126 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sema4dO09126 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sema4dO09126 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sema4dO09126 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sema4dO09126 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sema4dO09126 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sema4dO09126 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sema4dO09126 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sema4dO09126 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sema4dO09126 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sema4dO09126 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sema4dO09126 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sema4dO09126 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sema4dO09126 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sema4dO09126 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sema4dO09126 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sema4dO09126 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sema4dO09126 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sema4dO09126 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sema4dO09126 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sema4dO09126 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sema4dO09126 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sema4dO09126 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Sema4dO09126 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sema4dO09126 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sema4dO09126 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sema4dO09126 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sema4dO09126 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sema4dO09126 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sema4dO09126 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sema4dO09126 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sema4dO09126 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Sema4dO09126 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sema4dO09126 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Sema4dO09126 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sema4dO09126 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sema4dO09126 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sema4dO09126 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sema4dO09126 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Sema4dO09126 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sema4dO09126 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sema4dO09126 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sema4dO09126 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sema4dO09126 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema4dO09126 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sema4dO09126 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sema4dO09126 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sema4dO09126 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sema4dO09126 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sema4dO09126 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sema4dO09126 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sema4dO09126 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sema4dO09126 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sema4dO09126 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sema4dO09126 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sema4dO09126 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sema4dO09126 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sema4dO09126 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sema4dO09126 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sema4dO09126 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sema4dO09126 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sema4dO09126 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sema4dO09126 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sema4dO09126 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sema4dO09126 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema4dO09126 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sema4dO09126 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sema4dO09126 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sema4dO09126 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sema4dO09126 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sema4dO09126 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sema4dO09126 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sema4dO09126 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sema4dO09126 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sema4dO09126 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sema4dO09126 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sema4dO09126 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sema4dO09126 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sema4dO09126 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sema4dO09126 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms