Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sema3aO08665 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sema3aO08665 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema3aO08665 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sema3aO08665 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sema3aO08665 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sema3aO08665 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sema3aO08665 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Sema3aO08665 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sema3aO08665 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sema3aO08665 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sema3aO08665 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sema3aO08665 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sema3aO08665 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sema3aO08665 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sema3aO08665 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema3aO08665 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema3aO08665 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema3aO08665 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sema3aO08665 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sema3aO08665 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sema3aO08665 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sema3aO08665 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sema3aO08665 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema3aO08665 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema3aO08665 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema3aO08665 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sema3aO08665 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Sema3aO08665 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sema3aO08665 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sema3aO08665 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sema3aO08665 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema3aO08665 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sema3aO08665 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sema3aO08665 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema3aO08665 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema3aO08665 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema3aO08665 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema3aO08665 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sema3aO08665 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sema3aO08665 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sema3aO08665 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sema3aO08665 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sema3aO08665 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema3aO08665 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema3aO08665 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema3aO08665 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema3aO08665 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema3aO08665 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema3aO08665 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema3aO08665 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sema3aO08665 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema3aO08665 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema3aO08665 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema3aO08665 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema3aO08665 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema3aO08665 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sema3aO08665 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema3aO08665 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema3aO08665 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema3aO08665 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sema3aO08665 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema3aO08665 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sema3aO08665 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema3aO08665 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sema3aO08665 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sema3aO08665 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Sema3aO08665 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sema3aO08665 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema3aO08665 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema3aO08665 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sema3aO08665 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema3aO08665 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema3aO08665 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sema3aO08665 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema3aO08665 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sema3aO08665 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema3aO08665 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema3aO08665 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sema3aO08665 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema3aO08665 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sema3aO08665 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema3aO08665 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema3aO08665 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sema3aO08665 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sema3aO08665 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sema3aO08665 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema3aO08665 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema3aO08665 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sema3aO08665 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sema3aO08665 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema3aO08665 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema3aO08665 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema3aO08665 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema3aO08665 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sema3aO08665 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sema3aO08665 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema3aO08665 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema3aO08665 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sema3aO08665 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.3 ms