Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zfp955bL7N232 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp955bL7N232 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp955bL7N232 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp955bL7N232 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp955bL7N232 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp955bL7N232 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp955bL7N232 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp955bL7N232 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zfp955bL7N232 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp955bL7N232 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp955bL7N232 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zfp955bL7N232 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp955bL7N232 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zfp955bL7N232 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp955bL7N232 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zfp955bL7N232 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp955bL7N232 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zfp955bL7N232 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zfp955bL7N232 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp955bL7N232 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp955bL7N232 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zfp955bL7N232 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zfp955bL7N232 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zfp955bL7N232 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp955bL7N232 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp955bL7N232 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp955bL7N232 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zfp955bL7N232 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp955bL7N232 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zfp955bL7N232 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp955bL7N232 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp955bL7N232 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp955bL7N232 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp955bL7N232 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zfp955bL7N232 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zfp955bL7N232 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zfp955bL7N232 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp955bL7N232 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zfp955bL7N232 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zfp955bL7N232 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp955bL7N232 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zfp955bL7N232 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp955bL7N232 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zfp955bL7N232 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp955bL7N232 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zfp955bL7N232 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp955bL7N232 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp955bL7N232 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp955bL7N232 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zfp955bL7N232 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp955bL7N232 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zfp955bL7N232 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp955bL7N232 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zfp955bL7N232 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zfp955bL7N232 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zfp955bL7N232 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zfp955bL7N232 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zfp955bL7N232 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp955bL7N232 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp955bL7N232 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp955bL7N232 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zfp955bL7N232 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp955bL7N232 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Zfp955bL7N232 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp955bL7N232 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zfp955bL7N232 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Zfp955bL7N232 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zfp955bL7N232 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp955bL7N232 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp955bL7N232 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp955bL7N232 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp955bL7N232 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp955bL7N232 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zfp955bL7N232 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp955bL7N232 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Zfp955bL7N232 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zfp955bL7N232 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp955bL7N232 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp955bL7N232 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zfp955bL7N232 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp955bL7N232 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp955bL7N232 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp955bL7N232 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Zfp955bL7N232 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp955bL7N232 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp955bL7N232 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp955bL7N232 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp955bL7N232 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zfp955bL7N232 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp955bL7N232 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zfp955bL7N232 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp955bL7N232 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zfp955bL7N232 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zfp955bL7N232 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp955bL7N232 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp955bL7N232 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp955bL7N232 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp955bL7N232 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp955bL7N232 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms