Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ14

Gm4791, Predicted gene 4791, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4791J3QQ14 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm4791J3QQ14 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm4791J3QQ14 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm4791J3QQ14 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm4791J3QQ14 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm4791J3QQ14 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm4791J3QQ14 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm4791J3QQ14 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm4791J3QQ14 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm4791J3QQ14 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm4791J3QQ14 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm4791J3QQ14 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm4791J3QQ14 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm4791J3QQ14 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm4791J3QQ14 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm4791J3QQ14 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm4791J3QQ14 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm4791J3QQ14 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm4791J3QQ14 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm4791J3QQ14 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm4791J3QQ14 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm4791J3QQ14 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm4791J3QQ14 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm4791J3QQ14 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm4791J3QQ14 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm4791J3QQ14 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm4791J3QQ14 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm4791J3QQ14 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm4791J3QQ14 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm4791J3QQ14 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm4791J3QQ14 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm4791J3QQ14 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm4791J3QQ14 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm4791J3QQ14 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm4791J3QQ14 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm4791J3QQ14 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm4791J3QQ14 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm4791J3QQ14 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm4791J3QQ14 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm4791J3QQ14 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm4791J3QQ14 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm4791J3QQ14 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm4791J3QQ14 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm4791J3QQ14 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm4791J3QQ14 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm4791J3QQ14 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm4791J3QQ14 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm4791J3QQ14 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm4791J3QQ14 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm4791J3QQ14 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm4791J3QQ14 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm4791J3QQ14 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm4791J3QQ14 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm4791J3QQ14 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm4791J3QQ14 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm4791J3QQ14 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm4791J3QQ14 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm4791J3QQ14 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm4791J3QQ14 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm4791J3QQ14 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm4791J3QQ14 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm4791J3QQ14 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm4791J3QQ14 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm4791J3QQ14 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm4791J3QQ14 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm4791J3QQ14 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm4791J3QQ14 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm4791J3QQ14 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm4791J3QQ14 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm4791J3QQ14 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm4791J3QQ14 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm4791J3QQ14 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm4791J3QQ14 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm4791J3QQ14 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm4791J3QQ14 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm4791J3QQ14 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm4791J3QQ14 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm4791J3QQ14 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4791J3QQ14 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm4791J3QQ14 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm4791J3QQ14 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4791J3QQ14 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4791J3QQ14 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm4791J3QQ14 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm4791J3QQ14 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4791J3QQ14 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm4791J3QQ14 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm4791J3QQ14 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm4791J3QQ14 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm4791J3QQ14 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm4791J3QQ14 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm4791J3QQ14 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm4791J3QQ14 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm4791J3QQ14 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm4791J3QQ14 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm4791J3QQ14 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm4791J3QQ14 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm4791J3QQ14 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm4791J3QQ14 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm4791J3QQ14 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.8 ms