Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21818J3KMS6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21818J3KMS6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21818J3KMS6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21818J3KMS6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm21818J3KMS6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21818J3KMS6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21818J3KMS6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21818J3KMS6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm21818J3KMS6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm21818J3KMS6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm21818J3KMS6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm21818J3KMS6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm21818J3KMS6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm21818J3KMS6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm21818J3KMS6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm21818J3KMS6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm21818J3KMS6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm21818J3KMS6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm21818J3KMS6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm21818J3KMS6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm21818J3KMS6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm21818J3KMS6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm21818J3KMS6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm21818J3KMS6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm21818J3KMS6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm21818J3KMS6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm21818J3KMS6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm21818J3KMS6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm21818J3KMS6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm21818J3KMS6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm21818J3KMS6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm21818J3KMS6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm21818J3KMS6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm21818J3KMS6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm21818J3KMS6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm21818J3KMS6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm21818J3KMS6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm21818J3KMS6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm21818J3KMS6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm21818J3KMS6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm21818J3KMS6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm21818J3KMS6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm21818J3KMS6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm21818J3KMS6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm21818J3KMS6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm21818J3KMS6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm21818J3KMS6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21818J3KMS6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21818J3KMS6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21818J3KMS6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21818J3KMS6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm21818J3KMS6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21818J3KMS6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21818J3KMS6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21818J3KMS6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21818J3KMS6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21818J3KMS6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm21818J3KMS6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm21818J3KMS6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm21818J3KMS6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21818J3KMS6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm21818J3KMS6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21818J3KMS6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21818J3KMS6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21818J3KMS6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm21818J3KMS6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm21818J3KMS6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm21818J3KMS6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm21818J3KMS6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm21818J3KMS6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm21818J3KMS6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21818J3KMS6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm21818J3KMS6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm21818J3KMS6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21818J3KMS6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21818J3KMS6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm21818J3KMS6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21818J3KMS6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21818J3KMS6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm21818J3KMS6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21818J3KMS6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21818J3KMS6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm21818J3KMS6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21818J3KMS6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm21818J3KMS6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21818J3KMS6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21818J3KMS6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21818J3KMS6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21818J3KMS6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21818J3KMS6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21818J3KMS6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21818J3KMS6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21818J3KMS6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21818J3KMS6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21818J3KMS6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21818J3KMS6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21818J3KMS6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm21818J3KMS6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21818J3KMS6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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