Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Gm21818J3KMS6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gm21818J3KMS6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gm21818J3KMS6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gm21818J3KMS6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm21818J3KMS6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm21818J3KMS6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm21818J3KMS6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm21818J3KMS6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm21818J3KMS6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm21818J3KMS6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm21818J3KMS6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm21818J3KMS6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm21818J3KMS6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm21818J3KMS6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm21818J3KMS6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm21818J3KMS6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm21818J3KMS6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm21818J3KMS6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm21818J3KMS6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm21818J3KMS6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm21818J3KMS6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm21818J3KMS6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gm21818J3KMS6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm21818J3KMS6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm21818J3KMS6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm21818J3KMS6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm21818J3KMS6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm21818J3KMS6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm21818J3KMS6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm21818J3KMS6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm21818J3KMS6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm21818J3KMS6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm21818J3KMS6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm21818J3KMS6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm21818J3KMS6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm21818J3KMS6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm21818J3KMS6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm21818J3KMS6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm21818J3KMS6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm21818J3KMS6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm21818J3KMS6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm21818J3KMS6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm21818J3KMS6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm21818J3KMS6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm21818J3KMS6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm21818J3KMS6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm21818J3KMS6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm21818J3KMS6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm21818J3KMS6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm21818J3KMS6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm21818J3KMS6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm21818J3KMS6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm21818J3KMS6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm21818J3KMS6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm21818J3KMS6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm21818J3KMS6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm21818J3KMS6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm21818J3KMS6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm21818J3KMS6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm21818J3KMS6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm21818J3KMS6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm21818J3KMS6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm21818J3KMS6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm21818J3KMS6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm21818J3KMS6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm21818J3KMS6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm21818J3KMS6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm21818J3KMS6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm21818J3KMS6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm21818J3KMS6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm21818J3KMS6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm21818J3KMS6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm21818J3KMS6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm21818J3KMS6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm21818J3KMS6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm21818J3KMS6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm21818J3KMS6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm21818J3KMS6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm21818J3KMS6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm21818J3KMS6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm21818J3KMS6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm21818J3KMS6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm21818J3KMS6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm21818J3KMS6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm21818J3KMS6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm21818J3KMS6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm21818J3KMS6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm21818J3KMS6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm21818J3KMS6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm21818J3KMS6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm21818J3KMS6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm21818J3KMS6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm21818J3KMS6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm21818J3KMS6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm21818J3KMS6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm21818J3KMS6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm21818J3KMS6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm21818J3KMS6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm21818J3KMS6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms