Protein–RNA interactions for Protein: D3YU50

Mybpc1, Myosin-binding protein C, slow-type, mousemouse

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybpc1D3YU50 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mybpc1D3YU50 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mybpc1D3YU50 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mybpc1D3YU50 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mybpc1D3YU50 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mybpc1D3YU50 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mybpc1D3YU50 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mybpc1D3YU50 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mybpc1D3YU50 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mybpc1D3YU50 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mybpc1D3YU50 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mybpc1D3YU50 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mybpc1D3YU50 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mybpc1D3YU50 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mybpc1D3YU50 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mybpc1D3YU50 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mybpc1D3YU50 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mybpc1D3YU50 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mybpc1D3YU50 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mybpc1D3YU50 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mybpc1D3YU50 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mybpc1D3YU50 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mybpc1D3YU50 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Mybpc1D3YU50 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mybpc1D3YU50 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Mybpc1D3YU50 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mybpc1D3YU50 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mybpc1D3YU50 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mybpc1D3YU50 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mybpc1D3YU50 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mybpc1D3YU50 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mybpc1D3YU50 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mybpc1D3YU50 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mybpc1D3YU50 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mybpc1D3YU50 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mybpc1D3YU50 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mybpc1D3YU50 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mybpc1D3YU50 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mybpc1D3YU50 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mybpc1D3YU50 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mybpc1D3YU50 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mybpc1D3YU50 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mybpc1D3YU50 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mybpc1D3YU50 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mybpc1D3YU50 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mybpc1D3YU50 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mybpc1D3YU50 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mybpc1D3YU50 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mybpc1D3YU50 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mybpc1D3YU50 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mybpc1D3YU50 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mybpc1D3YU50 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mybpc1D3YU50 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Mybpc1D3YU50 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mybpc1D3YU50 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mybpc1D3YU50 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mybpc1D3YU50 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mybpc1D3YU50 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mybpc1D3YU50 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mybpc1D3YU50 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mybpc1D3YU50 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mybpc1D3YU50 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mybpc1D3YU50 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mybpc1D3YU50 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mybpc1D3YU50 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24■■□□□ 1.43
Mybpc1D3YU50 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mybpc1D3YU50 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Mybpc1D3YU50 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mybpc1D3YU50 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mybpc1D3YU50 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mybpc1D3YU50 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mybpc1D3YU50 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mybpc1D3YU50 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mybpc1D3YU50 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mybpc1D3YU50 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mybpc1D3YU50 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mybpc1D3YU50 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mybpc1D3YU50 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mybpc1D3YU50 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mybpc1D3YU50 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mybpc1D3YU50 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mybpc1D3YU50 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mybpc1D3YU50 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mybpc1D3YU50 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mybpc1D3YU50 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Mybpc1D3YU50 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mybpc1D3YU50 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mybpc1D3YU50 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Mybpc1D3YU50 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mybpc1D3YU50 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mybpc1D3YU50 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mybpc1D3YU50 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Mybpc1D3YU50 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mybpc1D3YU50 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mybpc1D3YU50 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mybpc1D3YU50 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mybpc1D3YU50 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mybpc1D3YU50 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mybpc1D3YU50 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mybpc1D3YU50 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms