Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm20547B8JJN0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm20547B8JJN0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm20547B8JJN0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm20547B8JJN0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm20547B8JJN0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm20547B8JJN0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm20547B8JJN0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm20547B8JJN0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm20547B8JJN0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm20547B8JJN0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm20547B8JJN0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm20547B8JJN0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm20547B8JJN0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm20547B8JJN0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm20547B8JJN0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm20547B8JJN0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm20547B8JJN0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm20547B8JJN0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm20547B8JJN0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm20547B8JJN0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm20547B8JJN0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm20547B8JJN0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm20547B8JJN0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm20547B8JJN0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm20547B8JJN0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm20547B8JJN0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm20547B8JJN0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm20547B8JJN0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm20547B8JJN0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm20547B8JJN0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm20547B8JJN0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm20547B8JJN0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm20547B8JJN0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm20547B8JJN0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm20547B8JJN0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm20547B8JJN0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm20547B8JJN0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm20547B8JJN0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm20547B8JJN0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm20547B8JJN0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm20547B8JJN0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm20547B8JJN0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm20547B8JJN0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm20547B8JJN0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm20547B8JJN0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm20547B8JJN0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm20547B8JJN0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm20547B8JJN0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm20547B8JJN0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm20547B8JJN0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm20547B8JJN0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm20547B8JJN0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm20547B8JJN0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm20547B8JJN0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm20547B8JJN0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm20547B8JJN0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm20547B8JJN0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm20547B8JJN0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm20547B8JJN0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm20547B8JJN0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm20547B8JJN0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm20547B8JJN0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm20547B8JJN0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm20547B8JJN0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm20547B8JJN0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm20547B8JJN0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm20547B8JJN0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm20547B8JJN0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm20547B8JJN0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm20547B8JJN0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm20547B8JJN0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm20547B8JJN0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm20547B8JJN0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm20547B8JJN0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20547B8JJN0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20547B8JJN0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20547B8JJN0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20547B8JJN0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20547B8JJN0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20547B8JJN0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20547B8JJN0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20547B8JJN0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20547B8JJN0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20547B8JJN0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20547B8JJN0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20547B8JJN0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20547B8JJN0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20547B8JJN0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm20547B8JJN0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm20547B8JJN0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm20547B8JJN0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm20547B8JJN0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm20547B8JJN0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm20547B8JJN0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm20547B8JJN0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm20547B8JJN0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm20547B8JJN0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm20547B8JJN0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm20547B8JJN0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms