Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ttll11A4Q9F4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ttll11A4Q9F4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ttll11A4Q9F4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ttll11A4Q9F4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ttll11A4Q9F4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ttll11A4Q9F4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ttll11A4Q9F4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll11A4Q9F4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ttll11A4Q9F4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttll11A4Q9F4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttll11A4Q9F4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttll11A4Q9F4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttll11A4Q9F4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttll11A4Q9F4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttll11A4Q9F4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttll11A4Q9F4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttll11A4Q9F4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttll11A4Q9F4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttll11A4Q9F4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ttll11A4Q9F4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttll11A4Q9F4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttll11A4Q9F4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttll11A4Q9F4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttll11A4Q9F4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttll11A4Q9F4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttll11A4Q9F4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttll11A4Q9F4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttll11A4Q9F4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttll11A4Q9F4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttll11A4Q9F4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttll11A4Q9F4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ttll11A4Q9F4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttll11A4Q9F4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ttll11A4Q9F4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttll11A4Q9F4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttll11A4Q9F4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ttll11A4Q9F4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttll11A4Q9F4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ttll11A4Q9F4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ttll11A4Q9F4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ttll11A4Q9F4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttll11A4Q9F4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttll11A4Q9F4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ttll11A4Q9F4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttll11A4Q9F4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ttll11A4Q9F4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttll11A4Q9F4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttll11A4Q9F4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ttll11A4Q9F4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttll11A4Q9F4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ttll11A4Q9F4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ttll11A4Q9F4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttll11A4Q9F4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ttll11A4Q9F4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttll11A4Q9F4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ttll11A4Q9F4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttll11A4Q9F4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ttll11A4Q9F4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttll11A4Q9F4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ttll11A4Q9F4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttll11A4Q9F4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ttll11A4Q9F4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttll11A4Q9F4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ttll11A4Q9F4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttll11A4Q9F4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttll11A4Q9F4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ttll11A4Q9F4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttll11A4Q9F4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttll11A4Q9F4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttll11A4Q9F4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttll11A4Q9F4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttll11A4Q9F4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ttll11A4Q9F4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ttll11A4Q9F4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttll11A4Q9F4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttll11A4Q9F4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttll11A4Q9F4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttll11A4Q9F4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttll11A4Q9F4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttll11A4Q9F4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ttll11A4Q9F4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttll11A4Q9F4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttll11A4Q9F4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ttll11A4Q9F4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ttll11A4Q9F4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttll11A4Q9F4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttll11A4Q9F4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttll11A4Q9F4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttll11A4Q9F4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttll11A4Q9F4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttll11A4Q9F4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttll11A4Q9F4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttll11A4Q9F4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttll11A4Q9F4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttll11A4Q9F4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttll11A4Q9F4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttll11A4Q9F4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttll11A4Q9F4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttll11A4Q9F4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms