Protein–RNA interactions for Protein: A2ASP7

9430015G10Rik, RIKEN cDNA 9430015G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9430015G10RikA2ASP7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
9430015G10RikA2ASP7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
9430015G10RikA2ASP7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
9430015G10RikA2ASP7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
9430015G10RikA2ASP7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
9430015G10RikA2ASP7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
9430015G10RikA2ASP7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
9430015G10RikA2ASP7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
9430015G10RikA2ASP7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
9430015G10RikA2ASP7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
9430015G10RikA2ASP7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
9430015G10RikA2ASP7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
9430015G10RikA2ASP7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
9430015G10RikA2ASP7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
9430015G10RikA2ASP7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
9430015G10RikA2ASP7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
9430015G10RikA2ASP7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
9430015G10RikA2ASP7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
9430015G10RikA2ASP7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
9430015G10RikA2ASP7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
9430015G10RikA2ASP7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
9430015G10RikA2ASP7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
9430015G10RikA2ASP7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
9430015G10RikA2ASP7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
9430015G10RikA2ASP7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9430015G10RikA2ASP7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9430015G10RikA2ASP7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
9430015G10RikA2ASP7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
9430015G10RikA2ASP7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9430015G10RikA2ASP7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
9430015G10RikA2ASP7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
9430015G10RikA2ASP7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9430015G10RikA2ASP7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
9430015G10RikA2ASP7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
9430015G10RikA2ASP7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9430015G10RikA2ASP7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9430015G10RikA2ASP7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
9430015G10RikA2ASP7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9430015G10RikA2ASP7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
9430015G10RikA2ASP7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
9430015G10RikA2ASP7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
9430015G10RikA2ASP7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
9430015G10RikA2ASP7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9430015G10RikA2ASP7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9430015G10RikA2ASP7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
9430015G10RikA2ASP7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
9430015G10RikA2ASP7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
9430015G10RikA2ASP7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
9430015G10RikA2ASP7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
9430015G10RikA2ASP7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
9430015G10RikA2ASP7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
9430015G10RikA2ASP7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
9430015G10RikA2ASP7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
9430015G10RikA2ASP7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
9430015G10RikA2ASP7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
9430015G10RikA2ASP7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
9430015G10RikA2ASP7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
9430015G10RikA2ASP7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
9430015G10RikA2ASP7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9430015G10RikA2ASP7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
9430015G10RikA2ASP7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
9430015G10RikA2ASP7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
9430015G10RikA2ASP7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
9430015G10RikA2ASP7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
9430015G10RikA2ASP7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
9430015G10RikA2ASP7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
9430015G10RikA2ASP7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
9430015G10RikA2ASP7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
9430015G10RikA2ASP7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
9430015G10RikA2ASP7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
9430015G10RikA2ASP7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
9430015G10RikA2ASP7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9430015G10RikA2ASP7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9430015G10RikA2ASP7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9430015G10RikA2ASP7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
9430015G10RikA2ASP7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9430015G10RikA2ASP7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9430015G10RikA2ASP7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
9430015G10RikA2ASP7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
9430015G10RikA2ASP7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
9430015G10RikA2ASP7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9430015G10RikA2ASP7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9430015G10RikA2ASP7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
9430015G10RikA2ASP7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
9430015G10RikA2ASP7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
9430015G10RikA2ASP7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
9430015G10RikA2ASP7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
9430015G10RikA2ASP7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
9430015G10RikA2ASP7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
9430015G10RikA2ASP7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
9430015G10RikA2ASP7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
9430015G10RikA2ASP7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
9430015G10RikA2ASP7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9430015G10RikA2ASP7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9430015G10RikA2ASP7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
9430015G10RikA2ASP7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
9430015G10RikA2ASP7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9430015G10RikA2ASP7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
9430015G10RikA2ASP7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
9430015G10RikA2ASP7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms