Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cul4bA2A432 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cul4bA2A432 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cul4bA2A432 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cul4bA2A432 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Cul4bA2A432 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cul4bA2A432 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cul4bA2A432 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cul4bA2A432 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cul4bA2A432 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cul4bA2A432 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Cul4bA2A432 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cul4bA2A432 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cul4bA2A432 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cul4bA2A432 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Cul4bA2A432 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cul4bA2A432 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cul4bA2A432 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cul4bA2A432 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cul4bA2A432 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cul4bA2A432 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cul4bA2A432 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cul4bA2A432 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cul4bA2A432 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cul4bA2A432 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cul4bA2A432 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cul4bA2A432 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cul4bA2A432 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cul4bA2A432 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cul4bA2A432 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cul4bA2A432 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul4bA2A432 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul4bA2A432 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cul4bA2A432 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cul4bA2A432 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cul4bA2A432 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cul4bA2A432 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cul4bA2A432 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cul4bA2A432 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul4bA2A432 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul4bA2A432 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cul4bA2A432 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cul4bA2A432 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cul4bA2A432 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul4bA2A432 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cul4bA2A432 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul4bA2A432 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cul4bA2A432 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cul4bA2A432 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cul4bA2A432 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul4bA2A432 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cul4bA2A432 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cul4bA2A432 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cul4bA2A432 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cul4bA2A432 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cul4bA2A432 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cul4bA2A432 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cul4bA2A432 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cul4bA2A432 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cul4bA2A432 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cul4bA2A432 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cul4bA2A432 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cul4bA2A432 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cul4bA2A432 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cul4bA2A432 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cul4bA2A432 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cul4bA2A432 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cul4bA2A432 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cul4bA2A432 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cul4bA2A432 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cul4bA2A432 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cul4bA2A432 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cul4bA2A432 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cul4bA2A432 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cul4bA2A432 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cul4bA2A432 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul4bA2A432 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cul4bA2A432 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cul4bA2A432 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cul4bA2A432 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cul4bA2A432 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cul4bA2A432 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cul4bA2A432 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cul4bA2A432 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cul4bA2A432 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cul4bA2A432 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul4bA2A432 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul4bA2A432 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cul4bA2A432 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cul4bA2A432 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cul4bA2A432 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cul4bA2A432 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cul4bA2A432 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cul4bA2A432 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cul4bA2A432 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cul4bA2A432 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cul4bA2A432 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Cul4bA2A432 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cul4bA2A432 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cul4bA2A432 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms