Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms