Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGC1AQ9UBK2 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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