Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TMPRSS4Q9NRS4 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms