Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BCO2Q9BYV7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms