Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
C4orf3Q8WVX3 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
C4orf3Q8WVX3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms