Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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TCF23Q7RTU1 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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TCF23Q7RTU1 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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TCF23Q7RTU1 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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TCF23Q7RTU1 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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TCF23Q7RTU1 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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TCF23Q7RTU1 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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TCF23Q7RTU1 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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TCF23Q7RTU1 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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TCF23Q7RTU1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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