Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL24

TMED8, Protein TMED8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED8Q6PL24 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMED8Q6PL24 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms