Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ZSCAN21-205ENST00000543588 1870 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 GRHL3-201ENST00000236255 1870 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RAET1K-202ENST00000533735 1883 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PKM-222ENST00000568883 1863 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 GPALPP1-202ENST00000361121 3410 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 HECW1-IT1-201ENST00000322220 1839 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 BBOF1-201ENST00000394009 3106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PRKCQ-201ENST00000263125 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
LINC01545Q5VT33 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms