Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSPP1Q1MSJ5 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms