Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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