Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 BTBD3-204ENST00000405977 5137 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NRF1Q16656 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms