Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PCDHB4-201ENST00000194152 3825 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 TRAF5-203ENST00000367004 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 GRIK1-203ENST00000389125 3140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 MRO-203ENST00000428869 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 STRA6-204ENST00000423167 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTF1Q16619 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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