Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
SSBP1Q04837 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms