Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP4P49662 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP4P49662 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP4P49662 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP4P49662 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP4P49662 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CASP4P49662 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms