Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RANGAP1P46060 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RANGAP1P46060 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms