Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ITGAEP38570 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms