Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARID4AP29374 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARID4AP29374 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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