Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GCAP28676 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCAP28676 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
GCAP28676 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
GCAP28676 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCAP28676 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCAP28676 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms