Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms